运用基因组学方法探究生物多样性_ 大数据时代的 胡克显微镜 .pdfVIP

生物多样性 2019, 27 (5): 475–479 doi: 10.17520/biods.2019161 Biodiversity Science •编者按• 运用基因组学方法探究生物多样性: 大数据时代的“胡克显微镜” 周 欣* ( 中国农业大学植物保护学院昆虫学系, 北京 100193) Understanding biodiversity using genomics: Hooke’s microscope in the era of big data * Xin Zhou Department of Entomology, College of Plant Protection, China Agricultural University, Beijing 100193 对生物多样性的好奇和欣赏是人类认识自然 内部器官结构、染色体特征、核酸/ 蛋白/ 小分子序 的重要动力, 而以探究和描述生物多样性为主要内 列、生理学等生物学或生态学特征的综合性证据。 容的分类学也是生命科学发展史上最早的分支学 而这些整合分类学特征均可以统一在林奈分类系 按 科之一。生物多样性为人类发展提供了基础和资源, 统下, 使得研究者不需要各自独创一套新的分类体 者 为生命机理的认知提供了模型, 也为维持可持续发 系, 而是可以在同一系统中不断完善物种的定义。 编 展的生态系统提供了重要的服务功能。 在此大背景之下, 研究者认识到各种生物特征 分类学是生物多样性研究的基础, 是我们分析 在界定物种和认知生物多样性方面均存在自身的 多样性组成、度量多样性变化、评价生态系统质量 优势和局限性。经典的形态分类学在特定的场景下 的核心工具。分类学使用生物固有的特征(traits)来进 遇到了较大的挑战, 例如同一物种的不同形态(如 行物种的界定(species delineation), 同时根据物种 真菌的孢子和子实体, 昆虫的不同生活史阶段)或 的定义进行物种鉴定(species identification) 。自林奈 生物体残片等。针对上述问题, 分子分类学(DNA 建立现代分类学体系后(Linnaeus, 1758), 研究者得 taxonomy)应运而生。核酸序列既是生物遗传信息的 以在一个稳定有序的方法系统内对物种的定义进 载体, 也是新性状产生的重要基础, 因而在演化过 行验证和修订, 成就了近300年来分类学以及生物 程中既具有一定的保守性, 也具有较强的类群特异 多样性知识体系的持续性积累。应该说, 林奈分类 性。这个特性很自然地被分类学家作为新的分类学 y e 学系统是一个经历了时间考验的科学框架, 实现了 特征应用于物种鉴定当中。耐人寻味的是, 微生物 t