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学 报
Journal of China Pharmaceutical University 2023 ,54 (3 ):355 - 362 355
基于人工智能的药物人体肠道吸收性质预测
*
濮澄韬,顾灵茜,陈兴晔,张艳敏
(中国药科大学理学院,医药大数据与人工智能研究院 ,南京 211198 )
摘 要 人体肠道吸收性(human intestinal absorption ,HIA )是衡量药物口服生物利用度的重要标志之一。利用人工智能方
法在药物发现早期对药物的HIA 进行预测评估,能够加速药物发现过程并且降低成本。本研究分别使用分子模拟软件
MOE (molecular operating environment )的2D 、3D 描述符和ECFP4 (extended connectivity fingerprints )对分子进行表征,针对
2 061 条HIA 数据建立支持向量机(SVM )、随机森林(RF )、深度神经网络(DNN )等8 种模型。结果表明,基于2D 、3D 描述符
和ECFP4 指纹的组合描述符构建的SVM 模型在各项评价指标上进行综合评价后是最优的,最优模型的受试者工作特征曲
线下面积(AUC )、马修斯系数和Kappa 系数分别为0. 94 ,0. 75 及0. 74 。综上,本研究建立一个鲁棒性高、泛化能力强的预测
HIA 性质的机器学习模型,该模型可以用于为药物药代动力学性质研究提供指导及早期的分子筛选。
关键词 人体肠道吸收;药代动力学性质;机器学习;深度神经网络;分类模型;人工智能
中图分类号 TP 18;R911 文献标志码 A 文章编号 1000 -5048 (2023 )03 -0355 -08
doi :10. 11665/j. issn. 1000 -5048. 2023032102
引用本文 濮澄韬,顾灵茜,陈兴晔,等. 基于人工智能的药物人体肠道吸收性质预测[J ]. 中国药科大学学报,2023 ,54(3 ):355 –362.
Cite this article as : PU Chengtao ,GU Lingqian ,CHEN Xingye , et al. Prediction of human intestinal absorption properties based on artificial
intelligence [J ].J China Pharm Univ ,2023 ,54(3 ):355 –362.
Prediction of human intestinal absorption properties based on artificial intel⁃
ligence
PU Chengtao, GU Lingqian, CHEN Xingye, ZHANG Yanmin*
Institute of Medical Big Data and Artificial Intelligence, School of Science, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China
Abstract Human intestinal absorption (HIA) is a crucial indicator for measuring the oral bioavailability of
drugs. This study aims to use artificial intelligence methods to predict and evaluate the HIA of drugs in the early
stages of drug discovery, thu
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