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卡介苗美国株基因组测序缺口修补策略及序列分析的中期报告
本报告旨在介绍卡介苗美国株基因组测序缺口修补策略及序列分析的中期情况。
首先,我们对卡介苗美国株进行了测序,并得到了高质量的基因组序列。然而,在对基因组进行初步分析时,我们发现其中存在着许多缺口。为了修补这些缺口,我们采取了以下的策略:
1. 针对低覆盖度区域,我们采用了Long-read Nanopore测序技术进行补充测序。通过这种方法,我们成功地修补了大量的缺口。
2. 对于高GC含量区域,我们使用了方法组合的策略。首先,我们使用了PacBio SMRT技术进行测序,再配合上Illumina HiSeq测序,最终得到了高可靠性的序列结果。同样,这种方法也取得了良好的效果。
经过上述策略的采用,我们成功地对卡介苗美国株的基因组进行了大量的缺口修复。目前,我们正在进行进一步的序列分析,包括基因预测、基因注释等方面的研究,以期更加深入地了解卡介苗美国株的遗传特征和生物学功能。
总的来说,我们的研究为卡介苗美国株基因组中的缺口修复提供了一种有效的策略,并取得了很好的研究进展。
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