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EGF刺激前后MDA-MB-468细胞核磷酸化蛋白质组学分析的中期报告
这是关于MDA-MB-468细胞核磷酸化蛋白质组学分析的中期报告,重点关注EGF刺激前后蛋白质的变化。
介绍:
EGF是一种重要的生长因子,参与许多细胞生长和分化的过程。MDA-MB-468细胞是一种人乳腺癌细胞,具有高度恶性和侵袭性。我们使用液相色谱质谱法(LC-MS/MS)技术对MDA-MB-468细胞进行蛋白质组学分析,以研究EGF刺激前后MDA-MB-468细胞核磷酸化蛋白质的变化。
方法:
1. 细胞培养和EGF刺激
MDA-MB-468细胞在含10%胎牛血清(FBS)的DMEM培养基中培养,37℃、5% CO2下培养。当细胞密度达到70%以上时,用DMEM液体培养基含1% FBS预处理12小时后,加入10ng/ml的EGF对细胞进行刺激,刺激时间为30分钟。
2. 细胞裂解
刺激后,使用磷酸盐缓冲液(PBS)清洗MDA-MB-468细胞,然后使用RIPA裂解液从细胞膜中提取全蛋白,包括磷酸化蛋白。
3. 蛋白质分离和富集
使用蛋白质A+G的亲和层析柱富集磷酸化蛋白,然后使用胶体电泳对蛋白质进行分离,获得等量的两个样品:EGF刺激前和刺激后的MDA-MB-468细胞核磷酸化蛋白样品。
4. 液相色谱质谱法分析
使用液相色谱质谱法对样品进行分析。使用Thermo Fisher Ultimate 3000 RSLCnano系统进行分离,使用Thermo Fisher Q-Exactive Plus质谱仪进行检测和数据分析。
结果:
比较EGF刺激前后的样品,我们发现许多磷酸化蛋白质存在数量上的变化。其中包括核转录因子NF-kB、STAT3等。我们还发现许多细胞信号通路中的蛋白质磷酸化发生变化,包括EGFR、ERK、AKT、mTOR等。这些蛋白质对于细胞的增殖和分化具有重要的作用。
结论:
EGF刺激前后,MDA-MB-468细胞核磷酸化蛋白质组发生了显著的变化,许多细胞信号通路受到了影响。这些结果为深入研究EGF对人乳腺癌发生和发展的影响提供了重要的参考。
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