分子动力学简介(简明).pptVIP

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2023-09-14 发布于广东
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分子动力学简介(简明).ppt

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* Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. C60对DNA结构的影响变形的角度吸附在A型DNA侧面的DNA使得DNA碱基对之间的相对结构变形。本应平行的碱基对变形形成了一个大约20度的角当前第63页\共有65页\编于星期二\18点 C60和单链DNA的作用 C60和单链DNA之间的结合导致单链DNA的严重变形 C60被单链DNA的某些部分包围，疏水的碱基平面和C60紧密接触 C60和单链DNA的结合能大约在?20到?30 kcal/mol 当前第64页\共有65页\编于星期二\18点结合部位水的结构 C60和DNA之间结合的驱动力是疏水作用 DNA亲水部位的水密度分布 C60和DNA结合部位的水密度分布当前第65页\共有65页\编于星期二\18点 * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * AIChE 05 #493i, Computational Studies of Self Assembly, Thursday, November 3, 2005, 2:38 pm, Cincinnati Convention Center, Rm 201 Today I am going to present you our recent monte carlo study of self assembly of benzenedithiolate-tetrahydrofuran mixture adsorption on gold surface * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. * Because such simulation is …. SHAKE，RATTLE 为保证原子各自运动时分子的整体性而添加的分子内部的约束条件算法最常见的是针对氢原子，因为氢原子很高的振动频率 Verlet算法：SHAKE 速度Verlet算法：RATTLE 当前第31页\共有65页\编于星期二\18点 NVE模拟 NVE，最简单的分子动力学 E=K+U 恒定体积，而且和外界没有能量或者物质交换，只有动能和势能之间的转换通过监视各能量项的变化，可以检查程序是否基本正确当前第32页