XXXX110 周三下午 合成生物学 NXP.pptxVIP

合成生物学Synthetic biology(概念、原理、应用);人工染色体(技术);合成生物学应运而生…;What is Synthetic Biology?;What is Synthetic Biology? 1. Biology 2. Chemistry 3. Engineering 4. Re-Writing;Biologists Chemists Engineers “Re-Writers”;Biology “Test models by building them” ;合成生物学;人工合成脊髓灰白质炎病毒cDNA;;Venter 实验室发展了合成基因组;合成生物学国际会议;合成生物学开辟了设计生命的前景;应用示例;应用示例;控制生命;;发展方向;;J. Craig Venter：基因组替换;人类历史上第一个人造染色体合成成功;;;;2022：Venter：Science;2022年的重要大事： “人造生命”诞生;《用化学合成的基因组构建一个细菌细胞》;实验对象：蕈状支原体。 支原体是已知的可以自由生活的最小生物,也是最小的原核细胞。 是一种原核微生物, 内部结构很简单，基因组仅有一百多万碱基对，远小于真核生物基因组十亿级的碱基数量，这也是Venter选择操作它的原因。 Venter早在1995年就对生殖支原体测序，并致力于研究维持自由生命的最小基因组。 在2022年，Venter的团队合成了长达59万碱基对的生殖支原体基因组。 此后，他们选择生长速度更快的蕈状支原体来做实验。 如果仅仅从技术上来说，Venter做了一个无懈可击的实验，“人造生命”思路和流程都做得无懈可击。 ;三个步骤：合成、组装和移植;;Venter：“创造了一个计算机为父母的生命”;JCVI：将8个由60个核苷酸组成的DNA片段，首次人工合成实验老鼠的线粒体基因组;;用途：生物能源、生物除污…;What is Synthetic Biology?;Synthetic Biology;Undergraduates in Synthetic Bio.;Lego Assembly for DNA Parts;Self-organized Pattern Formation;Lecture overview;Modifying life;Synthetic Biology History;Biotechnology 1.0 Research Workflow;DNA synthesis costs are dropping;Synthesis lengths are increasing;Commercial DNA Synthesis Companies;DNA Synthesis (Caruthers method);Microarray oligonucleotide synthesis;The power of parallelism;Oligonucleotides synthesized;In theory, the scale of synthesis is unlimited;Biotechnology 2.0 Research Workflow ;;The problem: “Dual Use” Research;How easy is it to get this technology?;What can we do?;Basic logic circuits;Protein Expression Basics;Regulation Through Repression and Induction;Logic Circuits;Transcription-Based Inverter;Simple Inverter Model;Cooperativity;Cooperative Inverter Model;BioCircuit Computer-Aided Design;Genetic Circuit Elements;A BioSPICE Inverter Simulation; They work in vivo Flip-flop (Gardner Collins, 2022) Ring oscillator (Elowitz Leibler, 2022) However, cells are very complex environments Current modeling techniques poorly predict behavior;Cellular Logic Summary ;Cellular Logic Summary ;Single Zinc-Finger Structure;Poly-F