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本发明公开了一种外泌体来源的ecDNA的建库方法。该建库方法包括：外泌体总DNA制备；外泌体线性DNA去除；外泌体ecDNA滚环扩增；滚环扩增产物超声打断；打断产物末端修复及A尾添加、加接头；PCR扩增及产物纯化、测序及数据分析。本发明采用单链核酸外切酶与双链核酸外切酶联用可以更加高效快速的去除线性DNA，从而最大限度的保证了ecDNA的纯度。另外本发明采用phi292.0DNA聚合酶进行滚环扩增，该聚合酶可以在42℃条件下持续的进行DNA合成，可有效缩短扩增时间，一般在1～2h内即可完成扩增。
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 116769876 A
(43)申请公布日 2023.09.19
(21)申请号 202210228603.1
(22)申请日 2022.03.08
(71)申请人 上海思路迪生物医学科技有限公司
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