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MicroRNAs与内侧颞叶癫痫发生发展机制的相关性研究的中期报告
该研究是探究MicroRNAs与内侧颞叶癫痫发生发展机制的相关性的,下面是中期报告:
研究目的:
1. 筛选差异表达的MicroRNAs;
2. 探究差异表达MicroRNAs的生物信息学功能;
3. 分析差异表达MicroRNAs靶基因的生物信息学功能和富集通路。
研究方法:
1. 采用dnaTools蛋白质分析工具,对内侧颞叶癫痫样本和对照样本的miRNA测序数据进行PAREmap比对;
2. 对比对后的结果进行差异分析,筛选出差异显著的miRNAs;
3. 采用TargetScan、miRanda和PicTar等软件,预测miRNAs的潜在靶基因;
4. 对靶基因进行生物信息学分析,并进行功能通路的富集分析。
研究结果:
1. 通过差异分析,共筛选出15个差异表达显著的miRNAs;
2. miRNAs的靶基因预测结果显示,这些miRNAs共预测到1160个靶基因;
3. 生物信息学分析发现,这些miRNAs的靶基因主要富集在神经营养因子、神经发育和细胞增殖等生物学过程中;
4. 富集通路分析结果显示,这些miRNAs的靶基因主要富集在Wnt信号通路和mTOR信号通路等。
结论:
通过对内侧颞叶癫痫样本和对照样本的miRNA测序数据的比对和差异分析,我们筛选出15个差异表达显著的miRNAs,并对这些miRNAs的靶基因进行了预测、生物信息学分析和功能通路的富集分析,发现这些miRNAs的靶基因主要富集在神经营养因子、神经发育和细胞增殖等生物学过程中,同时富集在Wnt信号通路和mTOR信号通路等,这表明这些miRNAs在内侧颞叶癫痫的发生和发展中可能发挥关键作用。
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