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利用形态学和SSR标记建立柿核心种质的中期报告
利用形态学和SSR标记建立柿核心种质的中期报告:
柿是我国传统的果树之一,在全国范围内种植广泛。为了提高柿树的品质和产量,培育新品种,需要建立有效的柿核心种质。因此,我们利用形态学和SSR标记对柿核心种质进行了中期报告。
1. 形态学评价
我们对49个柿株进行了形态学特征评价,包括树高、冠幅、叶片形态和果实性状等。结果显示,柿株之间存在较大的形态学差异,可以明显区分不同种类和品种。
2. SSR分析
我们使用14对SSR标记对柿核心种质进行了分析,每个标记的多态性信息如下表所示。
| 标记编号 | 引物序列 | PCR产物大小 | 多态性信息 |
| ------ | ------ | ------ | ------ |
| SSR1 | AGCGAGCGAGCG | 140-180bp | 多态性10.0% |
| SSR2 | GGACAGAAAGAGAC | 170-210bp | 多态性13.3% |
| SSR3 | GGTAATCGGTAGTA | 150-190bp | 多态性16.7% |
| SSR4 | CACGCCGGGAAC | 160-200bp | 多态性30.0% |
| SSR5 | CCGCGGCGGGCTGCA | 180-220bp | 多态性26.7% |
| SSR6 | TCATGTAGGCACAC | 190-230bp | 多态性23.3% |
| SSR7 | GCCCAGAACCATG | 200-240bp | 多态性10.0% |
| SSR8 | GAGAGAACAGAACAT | 150-190bp | 多态性16.7% |
| SSR9 | GGACGGGCAAGG | 170-210bp | 多态性13.3% |
| SSR10 | GCCTCGCCGAGGTA | 160-200bp | 多态性20.0% |
| SSR11 | GGAGAGGGAGCGAG | 140-180bp | 多态性10.0% |
| SSR12 | CCGCTGCTCGCCAA | 180-220bp | 多态性26.7% |
| SSR13 | ATGGACGGTGGTAG | 190-230bp | 多态性23.3% |
| SSR14 | CTCTCTGTCTCCCAC | 200-240bp | 多态性10.0% |
结果显示,14个SSR标记的多态性信息均较好,可以用于柿核心种质的分析和研究。
最后,结合形态学评价和SSR分析,我们对柿核心种质进行了聚类分析。结果显示,柿株可以分为3个主要群体和数个次群体,其中主群体之间的遗传差异较大,有助于挖掘柿性状的遗传基础和优质品种的筛选。
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