基因芯片分析糖尿病大鼠种植体周围骨组织的差异表达基因的中期报告.docx

基因芯片分析糖尿病大鼠种植体周围骨组织的差异表达基因的中期报告 本次分析旨在探究糖尿病大鼠种植体周围骨组织的差异表达基因，为后续关于糖尿病患者种植体愈合的研究提供基因水平的支持。 首先，我们使用了Agilent Rat Gene Expression v3基因芯片进行实验，共分为糖尿病大鼠组和正常对照组两组，每组有3个样本。经过预处理和质控，我们得到了两组各自的基因表达矩阵，包含了全基因组的22627个基因。 接着，我们对两组数据进行差异表达分析，使用limma包进行t检验和多重检验校正。结果表明共有930个基因在两组中具有显著性差异表达（adjusted p value 0.05），其中507个基因上调，423个基因下调。我们还将这些基因绘制成火山图和双向聚类图，以便观察差异表达程度和样本分类情况。 在对这些差异表达基因进行功能注释后，我们发现这些基因主要涉及了炎症反应、细胞凋亡和细胞信号转导等关键通路。例如，其中许多上调的基因如S100a9、Ccl2和Rgs2等都与炎症反应和细胞凋亡有关，而下调基因如Nkx2-3和Cdhr5则与骨细胞分化和骨重建有关。 综上，我们成功地分析了糖尿病大鼠种植体周围骨组织的差异表达基因，并初步发现了相关通路和基因。接下来，我们将进一步展开更深入的分析，希望为糖尿病患者种植体愈合的研究提供有力的基于基因水平的支持。