赤拟谷盗基因组中microRNA的生物信息学预测与进化分析.docVIP

赤拟谷盗基因组中microRNA的生物信息学预测与进化分析 目录 TOC \o 1-9 \h \z \u 目录 1 正文 2 文1：赤拟谷盗基因组中microRNA的生物信息学预测与进化分析 2 1材料和方法 3 1.1数据来源从UCSC数据库了赤拟谷盗的基因组数据 3 1.2赤拟谷盗基因组中miRNA的预测流程总体实验分 3 1.3赤拟谷盗基因组定位和成簇分析利用自己编写的Pe 4 1.4赤拟谷盗miRNA的靶标分析利用自己编写的Pe 4 1.5赤拟谷盗同源miRNA的分析根据前体序列以及二 4 2结果与讨论 5 2.1赤拟谷盗基因组miRNA的预测利用计算机编程的 5 2.2赤拟谷盗miRNA在基因组上的位置分布因为目前 5 2.3赤拟谷盗miRNA的家族进化分析根据序列和结构 6 2.4预测的miRNA的靶标分析miRNA可以通过切 6 文2：志贺菌外排泵基因emrE的克隆表达及进化分析 8 1 材料与方法 10 1.1 材料 10 1.2 志贺菌临床株多重耐药株的筛选 11 1.3 志贺菌基因组DNA的提取 11 1.4 志贺菌临床株多重耐药株emrE基因片段的获取 11 1.5 pMD-emrE重组质粒的构建 12 1.6 pMD-emrE重组菌