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《分子生物学》复习资料(一)
第一章 蛋白质的分子结构
1、蛋白质的三维结构称为构象,指的是蛋白质分子中所有原子在
三维空间中的排布,并不涉及共价键的断裂和生成所发生的变化。
2、维持和稳定蛋白质高级结构的因素有共价键(二硫键)和次级键,
次级键有 4 种类型,即离子键、氢键、疏水性相互作用和范德瓦力。
3、蛋白质的二级结构是指肽链中局部肽段的构象,它们是完整肽
链构象(三级结构)的结构单元,是蛋白质复杂的立体结构的基础,因此
二级结构也可以称为构象单元。α 螺旋、β 折叠是常见的二级结构。
4、一些肽段有形成 α 螺旋和 β 折叠两种构象的可能性(或形成势) ,
这类肽段被称为两可肽。
5、两个或几个二级结构单元被连接肽段连接起来,进一步组合成
有特殊几何排列的局域立体结构,称为超二级结构。超二级结构的基
本组织形式有 αα,βαβ 和 ββ 等 3 类。
6、蛋白质家族:一类蛋白质的一级结构有 30%以上同源性,或
一级结构同源性很低 ,但它们的结构和功能相似 ,它们也属于同一家
族。例如球蛋白的氨基酸序列相差很大 ,但属于同一家族。
超家族:有些蛋白质家族之间,一级结构序列的同源性较低 ,但
在许多情况下 ,它们的结构和功能存在一定的相似性。这表明它们可
能存在共同的进化起源。这些蛋白质家族属于同一超家族。
7、结构域是一个连贯的三维结构,是可互换并且半独立的功能单
位 ,在真核细胞中由一个外显子编码 ,由至少 40 个以上多至 200 个残
基构成最小、最紧密也最稳定的结构,作为结构和功能单位 ,会重复
出现在同一蛋白质或不同蛋白质中。
8、蛋白质一级结构所提供的信息有哪些 ?
①同源蛋白质的物种差异与生物进化。不同物种之间可变残基差
异的数目可提供物种之间亲源关系远近的信息。
②可以从一级结构推测出蛋白质的高级结构。
③在蛋白质数据库中,可根据某种蛋白质或其肽段的一级结构对
数据库进行同源性搜索,与已知蛋白质进行序列比较。
④在搜索功能上可能无关的蛋白质中发现有相关的同源性序列,
揭示了一些蛋白质还可能具有未被认识的新功能。
9、α-螺旋、β-折叠各自的特点?
①α-螺旋的特点:◆蛋白质多肽链像螺旋状盘曲,每隔 3.6 个氨基
酸残基沿中心轴螺旋上升一圈,每上升一圈沿螺旋轴方向上升 0.54nm ,
即每个氨基酸残基向上升高 0.15nm ,每个氨基酸残基沿中心轴旋转
100°。◆α-螺旋的稳定性是靠链内氢键维持的,相邻的螺圈之间形成
链内氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行。氢键是由每个氨基酸残基
的 N-H 与前面隔 3 个氨基酸的 C=O 形成的,肽链上所有的肽键都参
与了氢键的形成,因此 α-螺旋相当稳定。◆α-螺旋中氨基酸残基的侧
链伸向外侧。α-螺旋有左手螺旋和右手螺旋两种,但天然蛋白质的 α-
螺旋,绝大多数为右手螺旋。
②β-折叠的特点:◆由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列,
通过链间氢键交联而形成。肽链的主链呈锯齿状折叠现象 ,α-碳原子
总是处于折叠的角上,氨基酸的 R 基团交替分布在片层的两侧。◆β-折
叠结构的氢键主要是由两条肽链之间形成 ;也可以在同一肽链的不 同
部分之间形成。几乎所有肽键都参与链内氢键的交联 ,氢键与链的长
轴接近垂直。◆β-折叠有两种类型 :一为平行式 ,即所有肽链的 N-端
都在同一边 ,另一为反平行式。
第二章 核酸的结构
1、DNA 是由脱氧核糖核苷酸组成的长链多聚物 ,是遗传物质。
具有下列基本特性:
①具有稳定的结构 ,能进行复制 ,特定的结构能传递给子代;
②携带生命的遗传信息 ,以决定生命的产生、生长和发育;
③能产生遗传的变异 ,使进化永不枯竭。
2、DNA 链的方向总是理解为从 5’—P 端到 3’—OH 端。DNA
的一级结构实际上就是 DNA 分子内碱基的排列顺序。
3、DNA 是双螺旋结构 :主链由脱氧核糖和磷酸基团以 3’ ,
5’—磷酸二酯键交互连接构成的,在双螺旋的外侧,碱基在内侧,碱
基必须配对。一条链绕着另一条链旋转、盘绕,一条链上的嘌呤与另
一条链上的嘧啶相互配对,嘌呤与嘧啶以氢键保持在一起。
4、双螺旋 DNA 熔解成单链的现象称为 DNA 变性。已经变性的
DNA 在一定条件下重新恢复双
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