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- 2023-10-08 发布于上海
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笛鲷属鱼类长波段视蛋白(LWS)基因序列与进化的比较分析的中期报告
该研究旨在比较分析笛鲷属鱼类(Lutjanidae)长波段视蛋白(LWS)基因序列的进化历程。在研究中,我们获取了来自笛鲷属5个不同物种的LWS基因序列,并进行了多序列比对和系统发育分析。
首先,我们对比了这些LWS基因序列的同源性。结果显示,这些物种的LWS基因相似度非常高,其同源性达到了90%以上。这表明这些物种的LWS基因在进化过程中受到了高度保守的压力,这种保守可以解释为LWS基因在鱼类中的重要性质之一是色觉,因此这种保守可以保障这些鱼类在不同环境中的求生能力。
接下来,我们使用多种方法进行了进化分析,包括最邻近法、最大简约法和最大似然法。我们采用不同的进化模型来计算进化树,以确定这些物种LWS基因序列的进化历程。结果表明,这些物种的LWS基因序列被分为了两个主要分支,其分支节点的支持度非常高,这个结果在不同的进化分析方法下均得到了验证。我们也在这个分支上比较了不同的物种之间的进化关系,看到一些物种(例如white snapper),它们的LWS序列与其它物种有明显的不同。
总的来说,我们的研究表明笛鲷属鱼类LWS基因序列在进化过程中表现出高度的同源性和保守性,同时也展示了这些物种LWS序列之间的进化分支关系。今后我们将进一步探索在笛鲷属鱼类LWS基因在特定功能与环境的协同进化方面直至出现文化类行为等的分析
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