观赏芍药部分新种质SSR遗传多样性分析及DNA指纹科谱构建的中期报告.docxVIP

观赏芍药部分新种质SSR遗传多样性分析及DNA指纹科谱构建的中期报告 本研究对观赏芍药的新种质进行了SSR遗传多样性分析，并构建了DNA指纹科谱。具体步骤如下： 1.样本收集与DNA提取 本研究选取了来自不同地区的45份观赏芍药新种质作为研究对象。所有样本均在生长期间采集新鲜叶片，并使用CTAB法提取了高质量的基因组DNA。 2.SSR扩增与分析 从已发表的观赏芍药SSR引物中选择了10对具有高多态性和重复性的引物进行扩增。PCR反应体系为20μl，PCR产物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离后，用Goldview染色后进行评价。所有数据均输入到Microsoft Excel中进行数据整理和分析。 3.遗传多样性分析 使用PowerMarker软件分析了每个SSR位点的多态信息、位点间的遗传距离、聚类分析和主成分分析等。 4.DNA指纹科谱构建 计算了每个物种在所有SSR位点的等位基因频率，用SIMQUAL软件将每个物种的数据转化成二进制矩阵。通过UPGMA法进行聚类分析，在Excel和Arlequin软件中计算了遗传距离和方差分析，构建了DNA指纹科谱。 目前研究结果显示，45个观赏芍药新种质中，所有SSR基因都成功扩增，共检测到72个等位基因，平均每个位点7.2个等位基因。遗传多样性分析结果表明，SSR多态性非常高，平均观测频率为0.492，平均期望频率为0.468。主成分分析和聚类分析表明，这些新种质非常多样化，并可以根据其遗传特征划分为四个群体。DNA指纹科谱对不同品系的个体进行了有效区分，并为芍药新品种深入分析提供了基础。