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松材线虫乙酰胆碱酯酶ace-2基因的cDNA克隆与序列分析的中期报告
一、研究背景与意义
松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)是一种寄生于松树中的细线虫,是松树枯萎病的主要病原体,对林业经济造成了极大的危害。乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase, AChE)是一种重要的酶类,能代谢神经递质乙酰胆碱,发挥重要的生理作用,是抗感染药物和农药的重要靶标。因此,研究松材线虫AChE基因及其编码的酶分子结构和功能,对于深入研究松材线虫的生理生化机制,寻找新的防治途径具有重要的意义。
二、研究内容
1. 松材线虫的RNA提取和cDNA合成
从松材线虫的体内提取总RNA,使用反转录酶将RNA转录成cDNA。
2. ace-2基因的克隆
利用RT-PCR方法,采用2对引物,以BXSL735为模板,扩增得到了一条符合大小预期的ace-2基因片段,并进行了外显子边界序列确认。将该片段进行测序,确定其序列。
3. ace-2基因的序列分析
通过BLAST比对与序列整合软件进行与已知序列比对,并进行分析。
三、研究进展
1. RNA提取与cDNA合成方案不断优化,提取RNA质量与cDNA纯度良好。
2. 通过RT-PCR扩增得到一条ace-2基因片段,序列长度为1839 bp,推测编码618个氨基酸。
3. ace-2基因序列进行BLAST比对分析,结果表明与其他线虫ace-2基因具有较高的序列同源性。
4. 对ace-2基因的编码蛋白结构、功能进行深入分析。
未来,我们将对松材线虫的AChE基因进行更深入的功能研究,寻找新的防治方法,为松树枯萎病的防控提供理论支持。
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