乙烯调控拟南芥叶片衰老的分子机制研究及调控网络分析的中期报告.docxVIP

乙烯调控拟南芥叶片衰老的分子机制研究及调控网络分析的中期报告 本研究旨在探究乙烯调控拟南芥叶片衰老的分子机制，并使用系统生物学方法进行调控网络分析。截至目前，已经完成了实验设计、采集样品和RNA测序分析等初步工作，并取得以下进展： 1. 实验设计 通过采用拟南芥生长后期叶片作为实验材料，分别设置对照组和处理组，处理组分别暴露在1μM的乙烯和纯水中，共计3天。采用RNA测序技术分析对照组和处理组叶片基因表达谱差异。 2. 采集样品和RNA测序分析 采用Trizol法从对照组和处理组叶片中提取总RNA，经质量检测后，选出合格样品进行RNA测序。经过生物信息学分析，共筛选出1079个差异表达基因，其中578个上调、501个下调。 3. 基因功能富集分析及KEGG通路分析 采用DAVID数据库进行基因功能富集分析，结果表明差异表达基因主要富集在转录因子、酚酸类化合物代谢、苯丙氨酸代谢等生物学过程中。同时，通过KEGG通路分析发现，差异表达基因涉及许多与植物抗逆和生长发育相关的代谢途径、信号通路及调控因子等。 4. 调控网络分析 基于差异表达基因，构建了一个调控网络，包含198个基因和1640个调控关系。进一步利用cytohubba插件筛选出最重要的20个基因，包括3个上调基因（AT1G08030、AT1G26790和AT4G35040）和17个下调基因（AT1G16010、AT1G18570、AT2G21230、AT2G34710、AT2G36580、AT3G13800、AT3G60660、AT4G00120、AT4G03890、AT4G23620、AT5G58490、AT5G64740、AT5G65681、AT5G66730、AT5G66770、AT5G66940和AT5G67640）。 综上所述，通过RNA测序分析和基因功能富集分析，发现乙烯可能调控拟南芥叶片衰老过程中多个关键的代谢途径和信号调控因子，进一步通过调控网络分析，可以识别出乙烯调控拟南芥叶片衰老的最主要的关键基因。未来我们将继续进行验证实验，加强分析方法和技术的不断优化，以期更全面深入地探究乙烯调控拟南芥叶片衰老的分子机制。