基因组组装缺口的填补方法和装置.pdfVIP

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2023-10-14 发布于四川
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基因组组装缺口的填补方法和装置.pdf

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本发明提供了一种基因组组装缺口的填补方法和装置。该填补方法包括：从原组装基因组序列中提取出含有缺口的序列，含有缺口的序列包括缺口以及缺口的上下游序列；利用测序数据对含有缺口的序列中的缺口进行填补，得到缺口填补的序列；用缺口填补的序列替换原组装基因组中的含有缺口的序列。通过提取原组装基因组上含缺口区域的上下游序列，仅需对提取出含缺口的序列进行处理，减少后续处理的数据量。在利用测序数据对含有缺口的序列进行缺口填补时，由于仅需对提取出来的序列进行填补，而非对全基因组进行填补，因而数据量相对较小，内存占

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116884497 A (43)申请公布日 2023.10.13 (21)申请号 202310944042.X (22)申请日 2023.07.28 (71)申请人天津诺禾致源生物