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山羊全基因组测序及羊绒、羊毛毛囊转录组比较研究的中期报告
近年来,山羊作为一种重要的农畜物种,其羊乳、羊肉、羊毛等方面的应用价值愈发凸显。为了进一步了解山羊的遗传基础和生物学功能,全基因组测序及毛囊转录组比较研究已经成为当前重要的研究方向之一。
本研究选取贺生山山羊个体作为研究对象,采用Illumina HiSeq 2000平台进行全基因组测序。初步数据分析表明,贺生山山羊基因组大小约为2.97 Gb,GC含量为40.82%,基因注释数目约为25,000个。通过比对其他距离较近的有关模式生物的基因组数据,预计该物种基因组注释率可达到90%以上。另外,我们进行了羊绒和羊毛毛囊转录组比较研究,共获取了羊绒和羊毛毛囊的17,189个和23,306个Unigenes。
进一步的功能注释分析显示,全基因组注释结果发现该物种的重要代谢途径、信号通路、免疫反应和调控网络等方面的基因,在其参与细胞代谢、生长、分化、发育、繁殖和适应环境等生物学过程中具有重要的生物学作用。而羊绒和羊毛毛囊转录组比较分析显示,羊绒和羊毛毛囊在生长速度、柔软度、色泽等方面存在差异,其差异基因可能与多种的代谢途径、细胞周期和信号传递等方面有关。
综上所述,本研究对贺生山山羊进行的全基因组测序及其羊绒、羊毛毛囊转录组比较研究,为该物种的遗传基础和生物学功能研究提供了重要的数据基础,并为其后续进一步研究奠定了坚实的基础。
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