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家禽肠道微生物多样性的影响因素 动物胃肠道有相对稳定的微生物群落。菌群的多样性能够保证肠道微生物区系平衡。胃中因有胃酸使微生物数量较少, 十二指肠、空肠、回肠微生物数量相对较多, 结肠、盲肠中微生物数量最多。微生物群落能够维持胃肠道环境相对稳定, 促进营养物质消化吸收。本文就家禽肠道微生物菌群组成及其多样性的影响因素作一综述。 1 鸡囊中细菌群落及菌群结构 家禽肠道菌群的建立具有明显的特点。刚出壳的雏鸡其肠道内无细菌, 通过空气、饮用水和饲料等途径从外界环境中带入细菌。其中一部分细菌在肠道中定居, 经过生长繁殖成为正常菌群, 这种菌群在消化道中密度很高, 占消化道细菌的绝大部分, 主要由专性厌氧菌组成;一部分菌群暂时在动物肠道内生存, 这部分细菌在消化道中的密度很低, 主要由外籍菌群和环境菌群构成, 以需氧和兼性厌氧菌为主;还有一部分细菌不能适应肠道环境或动物体不需要, 则随粪便排出体外。研究表明:鸡嗉囊中的优势菌群主要是乳酸杆菌;空肠和直肠中的优势菌群是乳酸杆菌、双歧杆菌及拟杆菌, 其次是消化球菌和弯曲杆菌;回肠内的优势菌群主要是乳酸杆菌;盲肠中细菌的种类和数量最多。 家禽的大肠很短, 食糜会很快进入盲肠, 所以盲肠是微生物生存和活动的重要场所。倪学勤等 (2008) 采用变性梯度凝胶电泳 (PCR-DGGE) 技术研究0~8周龄蛋鸡各肠段菌群的多样性, 结果表明蛋鸡盲肠内细菌种类最丰富, 且与其他肠段有很大差异。蛋鸡消化道前段微生物由简单 (2周龄) 到复杂 (4周龄) , 再恢复简单 (6周龄) 到复杂 (8周龄) , 最后趋于稳定的变化过程, 而8周龄盲肠微生物的多样性与前6周相比差异不显著。李永洙和Cui (2011) 采用PCR-DGGE技术测定鸡在生长发育中盲肠微生物的菌群结构, 结果显示乳杆菌数量最高, 双歧杆菌次之, 肠球菌最低, 乳杆菌和双歧杆菌的数量极显著高于其他菌种。Barnes和Impey (1970) 研究指出, 成年鸡盲肠内类杆菌、真杆菌、消化球菌和乳酸杆菌是优势菌群, 其中双歧杆菌数量占绝对优势。Lu等 (2003) 利用保守序列16S r RNA的分子生物学方法研究发现, 鸡盲肠中梭菌属约65%, 为优势菌群;其次是梭杆菌属14%、乳酸杆菌群8%及拟杆菌属5%, 各个菌种的比例大致保持平衡。何明清 (1994) 认为鸡盲肠最优势菌群为真杆菌、拟杆菌、消化链球菌及双歧杆菌, 乳酸杆菌次之, 大约108个/g, 链球菌和肠杆菌约为107~108个/g, 而产气荚膜梭菌、葡萄球菌和酵母菌数量少且不稳定。 2 影响鸟类和肠道菌群组成的因素 2.1 不同饲粮纤维对肉仔鸡肠道微生物群落的影响 饲粮是影响肠道菌群组成的最大因素, 如饲粮类型及饲粮粗纤维、碳水化合物、蛋白质等含量对肠道微生物菌群均产生影响。Torok等 (2008) 利用高通量测序法分析饲粮对肉仔鸡肠道菌群的影响, 结果显示空肠和盲肠内微生物群落受饲粮影响比较大。 饲粮谷物类型对肉仔鸡肠道微生物菌群的结构和多样性有一定的影响。田亚东等 (2013) 利用末端限制性片段长度多态性 (T-RFLP) 技术测定了玉米、小麦、大米为单一淀粉源配制的等能等氮饲粮对肉仔鸡肠道微生物群落多样性的影响, 发现十二指肠、空肠和回肠中优势菌群由限制性片段T-RF160、T-RF253、T-RF292代表, 大米饲粮组T-RF253和T-RF292片段代表的菌群优势度与玉米饲粮组和小麦饲粮组相比稍低, 大米饲粮组表现出微生物群落多样性程度高、优势种群少的趋势, 盲肠中优势菌群结构和含量与小肠相比差异较大。肉仔鸡肠道微生物群落的复杂度、丰富度及多样性方面在不同饲粮组间均无显著差异, 随着肠段向后推移, 微生物群落复杂度、丰富度及多样性均呈现先上升后稳定的趋势, 说明回肠和盲肠微生物物种比十二指肠和空肠更丰富多样, 且在回肠后趋于稳定。Wang等 (2007) 利用PCR-DDGE和16S r DNA序列分析技术研究得出, 饲喂整粒稻谷可以刺激猪肠道部分菌种生长, 但对主要菌群结构没有影响。Gabriel等 (2008) 对肉鸡的研究发现, 饲喂整粒小麦主要导致消化道前段肌胃和胰腺中菌群的变化, 对小肠和大肠影响很小。胡平等 (2010) 研究不同形态玉米饲粮对鹅肠道微生物区系的影响, 结果显示, 整粒玉米饲粮会导致回肠细菌种类增加和空肠细菌种类下降, 对十二指肠和盲肠菌群种类的影响不明显, 可能食糜在十二指肠和盲肠中停留时间最短, 所以对该肠段微生物菌群影响较小;而食糜在空肠、回肠中停留时间最长, 所以在这两个肠段产生作用的时间最长, 最终导致空肠和回肠的微生物区系变化较大;对直肠微生物影响处于两者之间。 Awati (2005) 研究指出, 饲粮组成影响健康动物