基于850K基因芯片的脑微出血DNA甲基化分子标志物筛选研究 (1).pdfVIP

分类号 ：R743.9 密级 ：公开 学校代码 ：11065 学号 ：2019026209 专业硕士学位论文 （统招全日制） 基于850K基因芯片的脑微出血DNA 甲基化分子标志物 筛选研究 作者姓名 钟美香 指导教师 郑雪平 副教授 专业领域 老年医学 培养单位 医学部(第一临床医学院） 答辩日期 2022.06.02 万方数据 基于850K基因芯片的脑微出血DNA 甲基化分子标志物筛选研究 摘 要 研究目的： 应用IlluminaInfinium Methylation EPICBeadChip （850K 芯片）筛选脑小血管病 （Cerebral SmallVesselDisease ，CSVD）中脑微出血 （CerebralMicrobleeds，CMBs） 相关的候选基因，探讨具有甲基化差异的基因可能的作用机制及其与临床影像学表型 之间可能的关系，寻找与CMBs发病机制相关并影响其发展的DNA 甲基化分子标志物。 研究方法： 按照纳排标准选取2020年1月至2021年12 月于青岛大学附属医院就诊的脑小血 1 CMBs 6 管病中具有微出血影像表现的患者以及体检受试者。 （）选取初筛人群： 组 4 2 72.83±11.26 6 4 例 （男性 例，女性 例），平均年龄： 岁；对照组 例 （男性 例，女 性2 例），平均年龄：71.50±9.77 岁。 （2）验证人群：CMBs组17 例 （男性10 例， 女性7 例），平均年龄:72.90±9.20 岁；对照组21例 （男性 12 例，女性9 例），平均 年龄：72.75±8.73 岁。利用850KDNA 甲基化芯片对初筛人群进行全基因组 DNA 甲 基化位点检测，筛选甲基化差异 （meth.diff）的绝对值大于0.1且显著性P0.05 的位 KEGG GO 5UTR 点，利用相关数据库进行生物信息学分析 （ 、 分析）；筛选位于 、 TSS200 TSS1500 第一外显子、 或 区并且所在位置具有潜在调控功能的位点，以此选取 CMBs机制相关并在DNA 甲基化表达上具有差异的候选基因；将样本量扩大至CMBs 组17 例和对照组21例，利用MethylTarget 分析对候选基因进行验证；分析差异化基 因的甲基化程度与CMBs 患者影像学表型之间的相关性。 研究结果： （1）850K DNA 甲基化芯片检测结果，具有统计学意义 （meth.diff 绝对值大于 0.1且显著性P0.05）的甲基化差异位点1700 个，共筛选出基因741个，其中高甲基 化位点616个，低甲基化位点1084个；GO 富集分析中与生物过程功能相关的条目4858 个，与分子功能相关的条