蛋白质折叠及其误折叠病问题的简单模型研究的中期报告.docxVIP

蛋白质折叠及其误折叠病问题的简单模型研究的中期报告 这项研究旨在通过构建简单的模型来研究蛋白质折叠及其误折叠病问题。在前期的研究中，我们提出了一个基于能量最小化的模型，通过计算蛋白质中的氨基酸相互作用来预测其折叠结构。我们还使用了分子动力学模拟来进一步验证模型的正确性。 在本次中期报告中，我们主要进行了以下工作： 首先，我们扩展了模型，考虑了蛋白质中碱性、酸性、疏水性、极性等不同类别的氨基酸的相互作用。我们使用了经验数据，并进行了大量的计算来确定各类氨基酸之间相互作用的参数。经过验证，扩展后的模型能够更准确地预测蛋白质的折叠结构。 其次，我们研究了蛋白质误折叠的问题。在现实生物体内，因为各种原因，蛋白质有可能折叠出不正常的结构，导致其功能的失调，甚至出现致命的误折叠病。我们通过引入外部扰动来模拟误折叠的过程，并研究了不同类型的氨基酸在误折叠过程中的变化情况。我们发现，疏水性氨基酸在误折叠中受到的影响较大，而极性氨基酸则相对稳定。 最后，我们计划进一步完善模型，考虑更多的生物化学和生物物理因素，以更好地研究蛋白质的折叠和误折叠问题。