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基于Gene Ontology和蛋白质互作网络特征优选药物敏感性基因的中期报告
为了对药物治疗敏感性基因进行更精确的预测,本研究结合了基因本体论(Gene Ontology)和蛋白质互作网络特征,提出了一种基于特征优选的算法。在这种方法中,我们首先使用基因本体论来筛选和聚类与药物治疗相关的基因,并通过起始基因集构建蛋白质互作网络。接下来,我们计算蛋白质互作网络中的节点度数、介数中心性以及聚类系数等特征,并使用随机森林算法进行特征选择和分类。
目前,我们已经完成了特征选择和分类模型的构建,并使用多个公共生物信息学数据库和大型基因表达谱数据集对该模型进行了验证和评估。结果表明,我们的方法可以在高度复杂的生物学系统中准确地预测药物敏感性基因,并与已有方法相比取得了更佳的性能。我们还在实验室中进行了真实细胞系和动物模型中的验证实验,并取得了良好的效果。
在接下来的研究中,我们将进一步完善该算法,并尝试对更多种类的药物敏感性进行预测。我们还将对算法进行更广泛的实验验证,并与其他方法进行比较和分析,以便更深入地了解该算法在未来临床药物治疗中的应用潜力。
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