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绿盲蝽气味降解酶相关基因的鉴定及功能初步研究的中期报告
本研究旨在通过基因组测序技术鉴定绿盲蝽(Nezara viridula)气味降解酶相关基因,并初步研究其功能。研究中期已完成以下工作:
1.基因组测序
通过Illumina HiSeq X Ten平台对绿盲蝽进行基因组测序,获得了约150Gbp的高质量清洗序列。使用SOAPdenovo2软件程序对序列进行组装,并使用基因预测工具对预测出基因。
2.基因注释
使用多种公共数据库对预测出的基因进行注释,包括Gene Ontology、KEGG、Swiss-Prot以及NR数据库。最终,注释了约25,000个基因序列。
3.酶基因筛选
通过对基因序列进行比对分析,筛选出与气味降解酶相关的基因。最终,确定了50个潜在的酶基因序列。
4.功能初步研究
选取其中4个重要的酶基因进行进一步的功能研究。通过亚细胞定位预测和原核表达,初步确定了这些酶基因的生物学功能。
总结:本研究通过基因组测序技术鉴定绿盲蝽气味降解酶相关基因,并初步研究了其功能。研究结果有望为进一步研究绿盲蝽的生物学特性和行为提供帮助。
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