基因组学功能基因组学蛋白质组学.pptVIP

其它的DNA标记（分子标记） AFLP（Amplified Fragment Length Polymorphism 即扩增片段的长度多态性） STS（序列位点标签）是由一段长度为２００～５００ｂｐ的序列所界定的位点，在基因组中只出现一次 RAPD（Random Amplfied Polymorphic DNA 随机扩增多态性ＤＮＡ） 本文档共125页；当前第63页；编辑于星期六\2点30分 遗传作图的方法 孟德尔遗传学简介 本文档共125页；当前第64页；编辑于星期六\2点30分 连锁分析 本文档共125页；当前第65页；编辑于星期六\2点30分 人类系谱分析的例子 本文档共125页；当前第66页；编辑于星期六\2点30分 酵母3号染色体遗传图与物理图比较 本文档共125页；当前第67页；编辑于星期六\2点30分 （二）物理图谱：人类基因组的物理图是指以已知核苷酸序列的DNA片段(序列标签位点，sequence-tagged site, STS)为“路标”，以碱基对(bp，kb，Mb)作为基本测量单位(图距)的基因组图。 本文档共125页；当前第68页；编辑于星期六\2点30分 物理作图常用的方法 1、荧光原位杂交图 2、限制性酶切图 3、辐射杂交细胞图 4、连续克隆系图 本文档共125页；当前第69页；编辑于星期六\2点30分 用不同颜色标记的各种DNA序列（探针），与染色体上的互补序列杂交而不破坏染色体的整体形态，显微镜下观察、辨认荧光标记在染色体上的定位而绘制的图谱。 1、荧光原位杂交图（FISH Map） 本文档共125页；当前第70页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第71页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第72页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第73页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第74页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第75页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第76页；编辑于星期六\2点30分 2、限制性酶切图：选用合适的限制性内切酶对基因组DNA或部分基因组DNA进行酶切，以获得以酶切位点为标记的物理图。 本文档共125页；当前第77页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第78页；编辑于星期六\2点30分 DNA分子限制性作图 获得理想大小的DNA片段对基因组的限制性作图至关重要，其关键是选择合适的限制酶 识别位点硷基数目 预计DNA片段平均长度（kb） 4 0.254 6 4 8 64 10 1000 本文档共125页；当前第79页；编辑于星期六\2点30分 限制性酶切制图的局限性 1、限制位点多时，产生大量的片段，难以排序 2、无法区分大小相同的片段 本文档共125页；当前第80页；编辑于星期六\2点30分 稀有切点限制图绘制 稀有切点限制酶系指该酶识别的碱基顺序在基因组中只有很少数量，可产生较大的DNA片段。 选用稀有切点限制酶时有几点必须注意： 1）一般而言，识别顺序越长产生的片段越大。但是，当识别位点中含有非特异顺序时，由于随机选择的干扰，片段的长度比预期的小。 2）识别位点的碱基组成影响限制性片段的大小。3）有些限制酶识别位点较长 ， 4）基因组DNA的甲基化状态。 本文档共125页；当前第81页；编辑于星期六\2点30分 3、辐射杂交细胞图：利用X－射线照射人细胞，使染色体随机断裂，然后与啮齿动物细胞杂交克隆，人染色体片段被整合到啮齿动物染色体上。两个相邻基因或标记越近，越可能出现在同一个片段而进入同一个杂交细胞。通过识别、定位技术及统计学分析可计算人DNA标志的连锁关系。 本文档共125页；当前第82页；编辑于星期六\2点30分 本文档共125页；当前第83页；编辑于星期六\2点30分 连续克隆系图：是最重要的一种图谱，以序列标签为标志。 序列标签： STS是基因组中任何单拷贝的长度在100～500bp之间的DNA序列，与核酸内切酶识别序列相关联。 序列标签的特点： 1、长度为100～500bp的已知序列； 2、在染色体上的位置明确； 3、可用PCR方法进行扩增的单一拷贝。 本文档共125页；当前第84页；编辑于星期六\2点30分 大片段DNA的分离回收 脉冲凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis, PFGE) 基本原理：将一个方向不断变换的电场取代简单的单一电场（单向电场），使电泳中受阻的DNA分子在电场改变时扭转迁移方向，达到分离的目的。 本文档共125页；当前第85页；编辑于星期六\2点30分 常规