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心之所向,所向披靡
imingxian提取RNA及用DEPC去除RNase的个人总结
快速的操作,低温环境,少量取上清
主要是抽提之后吸取上清时要特别小心,只要不把蛋白层吸出来就不会有
RNase污染。
分子克隆第二版343页,上关于提取RNA所用的玻璃容器的处理方法,是用前180度干烤8小时或更长时间;另一种方法是0.1%的depc水浸泡(37度2小时),然后灭菌水淋洗数次,100度干烤15分钟,然后高压灭菌除去depc.我们实验室一直是用170度考4小时,且不准离人,不准过夜,可能是怕烤箱长时间高温,线路老化会发生危险吧
提取RNA所用的枪头,EP管。直接高压烘干即可。如果用0.1%DEPC处理,要在DEPC配置后振摇1小时后再浸泡枪头,EP管方有效。我做的都是将枪头泡在配制好的depc中,摇振过夜,然后倒掉depc注意要到干净,再高压,为了防止仍残留液体可120度干烤一会
对于提取RNA来说,我认为关键的一点在于实验器材的准备.包括从最初的标本的制备,保存,以及之后的试剂的准备,匀浆器,镊子,tip头的去除RNase处理,尤其是去除RNase的DEPC处理步骤
您在处死大鼠前,先准备好干净的冻存管(用1.5ml的Ep管也可以,就是后面您在从液氮中取出的时候容易爆,您的注意安全),然后将去除的骨骼肌立即用干净的剪刀分成半颗到一颗黄豆大小,装入冻存管后立即投入液氮保存.个人认为在这
里使用装标本的管子没必要用DEPC处理
在提取RNA之前,将试剂(TRIzol)和器械(tip头,镊子,匀浆器)都准备好
从液氮取出标本后,立即转移进入事先加入TRIzol的匀浆器内(最好置冰上操作),立即匀浆,一直到标本完全碾磨碎,这个时候TRIzol液体成浑浊状,而且匀浆器的壁上没有太多的黏附组织,然后将TRIzol转出,继续后续的步骤.
1Rnase是一种蛋白酶,能够降解RNA。
我们的手上皮肤上有很多,应该是对我们的身体起保护作用。保护不被RNA
病毒感染?或者什么的。
这个酶高效稳定。要么在DEPC水中处理n小时,要么在160度高温烘烤6
小时。此酶才会失效。
所谓DEPC,是一种叫做焦碳酸二乙酯的东西。有毒啊。所谓DEPC水,一般指两种状态,a,配制好未消毒;b,配制好已消毒。通过高压消毒,该物质
会降解,从而无毒。
无菌蒸馏水中加入0.1%(v/v)焦碳酸二乙酯(DEPC),室温搅拌4小时以上至完全溶解,高压灭菌20分钟,冷却备用。这个是DEPC水的b状态。
如果你要用DEPC水处理Tips等等东东,那么就要用高压前的水,即DEPC水的a状态。把枪头管子等完全浸泡至少8小时,我一般都是过夜的,或者平
时就泡在里面备用。
RNA提取必须创造无RNase的环境,所有仪器与试剂均按照以下方法进行处理:研钵、研棒、药匙、玻璃器皿等需在180℃烘干4h以上;电泳槽、胶板、梳子、用0.1%~0.2%DEPC水处理过夜或者用洗涤灵清洗干净后用0.5%的
SDS(Sodiumdodecylsulfate,抑制RNase的活性)浸泡过夜,然后用ddH2O冲洗干净,晾干备用;离心管,枪头等塑料器皿要用0.1%~0.2%DEPC水处理之后(DEPC有致癌之嫌,须小心操作)。37℃保温12h以上,然后高压灭菌,灭活DEPC(Diethypyrocarbonate);溶液都需用经DEPC处理过的水配置,RNA提取的所有操作应尽可能在超净工作台上进行。
我们研究所里提RNA用的枪头和EP管都是高压两遍的,没有用DEPC水处理。1、有灭菌过的DEPC水,这一般是用来配75%乙醇用,因为乙醇若高压灭菌会挥发,所以乙醇是新开封专用的。
2、没有经高压灭菌的DEPC水,这主要是用于配你提RNA所用的其他试剂(所说的试剂是可以经高压灭菌的),总的来说,都得经过高压灭菌,目的就是要去除DEPC,以防止它以随后实验的干扰。
3、DEPC处理水:无菌蒸馏水中加入0.1%(v/v)焦碳酸二乙酯(DEPC),室温搅拌4小时以上,121度高压灭菌20分钟,冷却备用。
凡是不能用高温烘烤的材料如塑料容器等皆可用0.1%的焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液处理,再用蒸馏水冲净。DEPC是RNA酶的化学修饰剂,它和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环反应而抑制酶活性。DEPC与氨水溶液混合会产生致癌物,因而使用时需小心。试验所用试剂也可用DEPC处理,加入DEPC至0.1%浓度,
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