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三代测序技术在病原体鉴定研究中的应用进展

张春雷

上海伯杰医疗科技股份有限公司，上海201401

摘要：病原体鉴定一直是医学、生物学领域中的重要研究方向。传统的鉴定方法存在操作繁琐、样本处理困难、

检测时间长等缺点，且往往只能鉴定单一种病原体。随着三代测序技术的发展，病原体鉴定领域也得到了重要的

突破，三代测序技术在样本处理、序列分析等方面具有显著的优势。本文将对三代测序技术在病原体鉴定中的应

用进行综述，探讨其在细菌和病毒鉴定、抗生素耐药基因检测以及感染病原体研究等方面的应用案例，并讨论其

在病原体鉴定研究中的局限性和对策。

关键词：三代测序技术；病原体鉴定；应用案例；局限性；对策

中图分类号：R378

0引言1.2常用的病原体鉴定技术

目前，常用的病原体鉴定技术包括PCR技术、

病原体鉴定对于疾病诊断、疾病防治以及公共卫

MALDI-TOF质谱技术、核酸杂交技术和基因芯片技术等。

生等方面具有重要意义。传统的病原体鉴定方法存在

PCR技术是目前应用最广泛的病原体鉴定技术之一，可

诸多限制和不足，如操作繁琐、样本处理困难、检测

通过扩增病原体的特异性DNA片段进行鉴定。

时间长等。随着生物技术的不断发展，高通量测序技

MALDI-TOF质谱技术则是一种高通量、快速、精准、可

术逐渐应用于病原体鉴定研究中，其中三代测序技术

靠的病原体鉴定技术，可通过检测病原体的蛋白质质

具有独特的优势，可以实现高通量、快速、高精度的

量谱进行鉴定。核酸杂交技术是利用一段与病原体核

病原体鉴定。本文将介绍三代测序技术在病原体鉴定

酸特异结合的探针进行鉴定。基因芯片技术则是一种

中的应用进展，探讨其在细菌和病毒鉴定、抗生素耐

基于高通量芯片技术的病原体鉴定方法，可同时检测

药基因检测以及感染病原体研究等方面的应用案例，

多种病原体，具有高效、高通量、高灵敏度、高特异

并对其局限性和对策进行讨论。

性等特点。

1病原体鉴定相关分析

2三代测序技术的特点及优势

1.1病原体鉴定方法分类

三代测序技术具有高通量、高精度、高速度等特

病原体鉴定方法可按照不同的分类标准进行分类。

点，可以快速地、同时地、直接地获取单个DNA或RNA

根据检测目的不同，可将其分为两大类：一是定性检

分子的全长序列信息，相比于传统的二代测序技术，

测，即仅仅是确认样本中是否存在某一种病原体，例

具有以下几个优势：

如PCR技术；另一类是定量检测，即要确定病原体的

首先，三代测序技术可以直接测序DNA或RNA分

数量，例如数字PCR技术。根据检测原理不同，病原