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基因与基因组;
????;EcoRⅠ;HaeⅢ;EcoRⅠ;HaeⅢ;重组DNA技术(rebinationDNAtechnique)指将目得DNA片段或人工合成得基因,通过载体在体外重组、转移并插入到另一种生物得基因组中,使其表达为新得性状或用于进一步得研究,就是基因操作得核心技术。包括DNA克隆(DNAcloning)和分子杂交(molecularhybridization)。;构建;重组DNA技术流程简图;限制性内切核酸酶;20世纪人类科技发展史上得三大创举;大家学习辛苦了,还是要坚持;人类基因组计划
DNA得鸟枪法序列分析技术
比较基因组学及功能基因组研究;一、人类基因组计划得启动
1986年,诺贝尔奖获得者R、Dulbecco(杜尔贝科)提出人类基因组计划——测出人类全套基因组得DNA碱基序列(3×109bp)。;美国政府决定于1990年正式启动HGP,预计用15年时间,投入30亿美元,完成HGP。
由国立卫生研究院和能源部共同组成“人类基因组研究所”
逐渐地,HGP扩展为多国协作计划,参与者包括:英、日、法、德和中国(1993年)。;;?遗传图(geneticmap)
又称连锁图(linkagemap)
就是将每条染色体上得基因或遗传标记得相对位置经连锁分析确定下来,构成图谱。
遗传距离:
连锁图中两个基因间图距单位厘摩(cM)
1厘摩(cM)=减数分裂时两个基因间重组值为1%。;第一代(1975);多态性:人得DNA序列上平均每几百个碱基会出现一些变异(variation),并按照孟德尔遗传规律由亲代传给子代,从而在不同个体间表现出不同,因而被称为多态性(Polymorphism)。;第一代多态性标记就是RFLP(restrictionfragmentlengthpolymorphism,限制性片段长度多态性);第二代多态性标记就是短得串联重复序列
包括小卫星DNA和微卫星DNA,其多态性主要来自重复序列拷贝数得变化;小卫星DNA—由15-65bp得基本单位串联重复而成,长度一般不超过20kb。
重复次数(小卫星DNA区得长度)在人群中就是高度变异得;按照孟德尔得规律遗传;真核生物基因组中得DNA重复序列主要有哪些类型?简要说明基因组重复序列可能得生物学意义以及基因组重复序列在分子标记研究中得应用(12分)
中国科学院2002年
硕士学位研究生入学分子遗传学试题;第三代多态性标记就是单核苷酸得多态性
(singlenucleotidepolymorphism,SNP);人类99、9%得基因密码就是相同得,而差异不到0、1%,不同人群仅有140万个核苷酸差异。这些差异就是由“单一核苷酸多样性”(SNP)产生得,她构成了不同个体得遗传基础。在整个基因组序列中,人与人之间得变异仅为万分之一,从而说明人类不同“种属”之间并没有本质上得区别。
;SNP与RFLP和STR标记得主要不同之处在于,她不再以DNA片段得长度变化作为检测手段,而直接以序列变异作为标记。;l????????;序列图(sequencemap)
就是通过对基因组DNA进行碱基排列顺序分析而建立得。
两种技术路线:
1、公共序列路线:即在物理图基础上,将各个BAC克隆片段切成更短得片段,形成亚克隆分别进行测序,再将相互重叠得读出序列组装成连续重叠线。;2、“鸟枪法”测序路线:即直接将基因组DNA分割成20kb左右得小片段进行随机测序,再用超级计算机组装成重叠线。所形成得序列图称celera序列。
……………ACGTCCGATCGGTTCATGCC
TCGGTTCATGCCAATGCCGTCC…………
;第二节DNA得鸟枪法序列分析技术;1999年12
月用“逐个克隆法”获得第一条人类染色体—22号染色体完成序列;2000年3月用“全基因组鸟枪法”获得果蝇全基因组序列。
;2000年6月公共领域测序计划工作框架图;二、DNA得鸟枪法测序得主要步骤;Shotgun法序列拼接;三、DNA得鸟枪法测序得优缺点;基因图(genemap)
即在序列图基础上,用不同得方法测定各个基因所在区域位置。
基因图测定方法:
1、CpG岛得应用:大多数持家基因和40%组织特异性基因5’端均存在CpG岛序列。制备
探针,染色体涂染指示基因位置分布。
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二、人类基因组计划得进展状况
(1)截至1998年10月,完成1、8×108
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