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遗传性小脑型共济失调基因诊断平台的建立及新的致病基因的定位与克隆的开题报告
一、项目概述
遗传性小脑型共济失调(hereditaryataxia)是一组由遗传性因素引起的神经系统退行性疾病,主要表现为运动协调能力障碍、平衡失调和智力障碍等症状。目前已知有多种基因突变可导致该疾病,但相关数据分散、结论有限,影响了疾病的早期诊断和治疗。
本项目旨在基于先进的基因测序技术,建立遗传性小脑型共济失调基因诊断平台,开展高通量基因分析、新的致病基因的定位以及克隆等研究,为早期诊断和治疗提供基础数据和临床指导。
二、研究内容与方法
1.研究内容:
(1)构建基于SequenomMassARRAY和IlluminaHiSeq2000定量PCR的高通量测序平台,开展遗传性小脑型共济失调相关基因的筛查和测序分析;
(2)基于生物信息学技术,对筛查得到的基因进行网络分析、功能注释和通路富集分析等,挖掘新的致病基因;
(3)结合定量PCR、克隆、转染等技术手段,对挖掘得到的新致病基因进行生物学功能鉴定、亚细胞定位和分子机制研究等。
2.研究方法:
(1)从已知遗传性小脑型共济失调发生机制、分子异常和遗传模式入手,采用IlluminaNovaSeq6000测序仪加快筛查和测序速度,针对不同基因和样本进行高通量测序和分析;
(2)依据平台数据,结合基于Cytoscape、GeneMax等软件的生物信息学技术,对结果数据进行通路富集分析、功能注释、网络分析等,并开发新的分析算法;
(3)结合定量PCR、克隆、转染等技术手段,对挖掘得到的新致病基因进行进一步实验验证,实现生物学功能鉴定、亚细胞定位和分子机制研究等。
三、预期成果
1.建成遗传性小脑型共济失调基因诊断平台,实现高通量基因分析和筛查;
2.挖掘新的致病基因,构建基因网络图谱,为早期诊断和治疗提供基础数据和临床指导;
3.发表学术论文数篇,取得相关专利,为遗传性小脑型共济失调的研究领域做出贡献。
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