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“疑似沙眼”患者病原学初步研究的开题报告
一、研究背景
沙眼是由衣原体引起的传染病，主要通过眼结膜接触传播。沙眼在全球范围内都有发病情况，尤以发展中国家和落后地区为甚。我国是沙眼高发地区之一，且近年来沙眼疫情呈高发态势，成为严重的公共卫生问题。目前临床上，疑似沙眼的患者数量不断增加，对于疑似沙眼的病原学特征以及防控策略的制定有重要意义。
二、研究目的
通过对疑似沙眼患者眼结膜分泌物样本的分离纯化和序列分析，探究疑似沙眼的病原学特征和流行病学特征，为防控疑似沙眼疫情提供参考依据。
三、研究内容
1.疑似沙眼患者的样本收集和处理
在拟定的研究地区中，筛选符合疑似沙眼诊断标准的患者，并采集其眼结膜分泌物样本。样本经离心、分离纯化后提取DNA。
2.16SrRNA基因扩增和测序
运用PCR技术扩增样本中的细菌16SrRNA基因序列，扩增产物经纯化后测序，对序列进行分析和比对，鉴定患者眼结膜分泌物中存在的菌群种类和丰度。
3.序列分析及绘图
利用从GenBank数据库提取的16SrRNA基因序列作为参考，利用比对工具比对测序得到的序列，确定相应的细菌种类。然后，根据测序数据，生成菌群的热图，并通过生物信息学手段分析菌群的多样性和丰度变化规律。
四、预期结果
通过疑似沙眼患者眼结膜分泌物样本的病原学研究，探究其菌群多样性和丰度的变化规律，为研究其传播途径、疫情防控提出理论依据。
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