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弥漫大B细胞淋巴瘤预后相关基因与患者预后及肿瘤浸润性

免疫细胞比例的相关性

郭佳丽;潘晨华;李依;刘晓倩;蒋慧;常伟

【期刊名称】《山东医药》

【年(卷),期】2023(63)3

【摘要】目的筛选出弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关基因,明确预后相关基

因表达水平与DLBCL患者预后及肿瘤浸润性免疫细胞(TICs)比例的关系,为DLBCL

治疗提供新的靶点。方法从GEO中获取GSE56315、GSE12453和GSE87371

芯片数据,用R的“limma”包筛选出DLBCL预后相关基因。将GSE87371数据

集中的预后相关基因根据表达量中位值分为高、低表达组,从R语言的“survival”

包中提取高、低表达组5年OS率及95%CI,然后利用COX风险回归模型分析预

后相关基因与预后的相关性,使用R语言的“for”循环分析预后不良相关基因与

DLB-CL患者年龄、性别、临床分期等临床参数的关系。通过GSEA富集分析

DLBCL预后相关基因在DLBCL中的相关信号通路。最后利用CIBERSORT算法计

算DLBCL组织中TICs的比例,并分析预后相关基因表达水平与TICs比例的关系。

结果对GSE12353及GSE56315进行合并后的MERGE基因集进行筛选后获得

DLBCL组织与正常组织的差异表达基因445个(上调基因301个,下调基因143

个),从GSE87371数据集获得DLBCL预后相关基因57个(负相关17个,正相关40

个),将上调的301个差异表达基因与负相关的17个基因取交集,获得膜连蛋白

1(ANXA1),即为DLBCL预后相关基因。ANXA1高表达组5年OS率

3.56%,95%CI1.17%~10.7%,低表达组5年OS率17.49%,95%CI为

11.8%~29.9%,ANXA1高表达组DLBCL患者5年OS率低于低表达组

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(P0.001);ANXA1为DLBCL独立预后影响因子(P0.05);ANXA1表达水平与患

者临床参数无相关性(P0.05)。ANXA1在趋化因子信号通路、MAPK信号通路、

ECM受体相互作用、JAK-STAT信号通路等通路上富集。DLBCL组织中T细胞和

巨噬细胞比例较大,分别为49%、31%;ANXA1表达水平与巨噬细胞M2、浆细胞、

活性CD4+记忆T细胞、CD8+T细胞、γδT细胞比例正相关(P均0.001)。结论

DLBCL预后相关基因为ANXA1,ANXA1表达水平高与DLBCL患者预后不良及肿

瘤免疫浸润细胞比例相关,富集的信号通路主要有趋化因子信号通路等肿瘤相关信

号通路。

【总页数】4页(P33-36)

【作者】郭佳丽;潘晨华;李依;刘晓倩;蒋慧;常伟

【作者单位】武汉科技大学医学院;武汉科技大学附属普仁医院分子医学实验室;赤

峰市医院血液内科;武汉科技大学附属普仁医院血液科

【正文语种】中文

【中图分类】R551.2

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