分子力学基本原理.pptVIP

微观尺度材料设计??分子力学分子结构的优化首先，给出所计算分子的试探结构。不一定是分子的稳定构象，而且往往不是稳定构象。然后，将总空间能Es对所有描述分子构象的变量即分子各原子的三维坐标在一定的范围内求极小值。由于数学上只能保证求得局部极小值，即实现局部优化，而不一定能求得全局最小值。所以得到的是在这一构象附近的一相对稳定的构象。分子力学常用的优化方法有使用一阶导数的最速下降法和使用二阶导数的Newton-Raphson法。第31页，课件共47页，创作于2023年2月微观尺度材料设计??分子力学分子结构的优化粗结构能量极小构象分子几何优化E局部极小值问题；鞍点第32页，课件共47页，创作于2023年2月微观尺度材料设计??分子力学分子结构的优化用于描述分子初始结构的原子坐标可以使用分子内坐标、直角坐标或晶体坐标。从晶体数据得到初始结构数据往往是比较方便的，若没有晶体数据，则可用Dreiding模型来估计。输入坐标及连接关系力场选择、作用项、参数能量极小化最终结构与能量其它信息第33页，课件共47页，创作于2023年2月关于分子力学基本原理第1页，课件共47页，创作于2023年2月微观尺度材料设计??分子力学分子力学，又叫力场方法（forcefieldmethod），目前广泛地用于计算分子的构象和能量。