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稻弄蝶属Parnara的分子系统学研究的任务书

任务描述：

稻弄蝶属Parnara是一类重要的农业害虫，对于理解其种类分类和进化历史非常重要。本项目将利用分子系统学的方法探讨稻弄蝶属的分类学和演化关系。

任务目标：

1.对Parnara属的分类学地位进行研究，包括其种间关系和系统发育历史。

2.利用多序列分子标记（如mtDNA基因组、核基因序列等）构建Parnara属的系统发育树，可以结合形态特征进行分析。

3.利用分子时钟方法对Parnara属的进化速率和历史进行估计，并据此探讨其生物地理历史。

任务步骤：

1.获得Parnara属各种类标本，包括形态学研究及分子学分析所需的标本。

2.扩增并测序Parnara属标本所需的分子标记。使用常见分子标记，如mtDNACOI（cox1基因）、16SrRNA等和一些核基因，如EF1-α、WG等。

3.对测序结果进行质量控制和编辑，并进行序列比对和构建基于最大简约法（Maximumparsimony,MP）、最大似然法（Maximumlikelihood,ML）和贝叶斯法（Bayesianinference,BI）的系统发育树。

4.使用分子时钟方法对基于分子标记构建的系统发育树进行校准，并估计进化速率和divergencetime。

5.根据分子时钟和系统发育树结果推测Parnara属在不同地区的分化历史和演化过程，并结合其生物地理历史进行讨论。

参考文献：

1.Nakamura,K.,Yamaguchi,H.(2007).GeneticvariationandphylogenyofParnarabutterfly(Lepidoptera:Hesperiidae)inferredfrommitochondrialCOIsequences.EntomologicalScience,10(1),57-66.

2.Jing,X.,Liu,J.L.,Dong,Y.D.,Wang,M.,Shen,Z.R.,Wei,S.J.(2016).PhylogeneticrelationshipsofParnarasp.inChinainferredfrommitochondrialDNACOIsequences(Lepidoptera:Hesperiidae).FloridaEntomologist,99(4),590-596.

3.Shi,Q.H.,Wu,Y.P.(2019).MolecularphylogenyandhistoricalbiogeographyoftheParnaraspeciescomplex(Lepidoptera:Hesperiidae)inChina.EcologyandEvolution,9(5),2759-2769.