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2024-03-09 发布于四川
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样品病原细菌分型方法和系统.pdf

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本申请公开了构建病原细菌的核心基因参考短序列集的方法，其包括步骤确定每个核心基因的参考短序列，以建立核心基因参考短序列；其中从所述核心基因对应的全部型别中挑选一定数量的参考型别形成参考型别集，并将其中每个参考型别的核酸序列分解为一系列固定碱基长度的短序列，该一系列固定碱基长度的短序列即为该核心基因的参考短序列集。本申请还公开了基于该方法的系统以及基于该方法的样品病原细菌分型方法和系统。本申请提供的方法和系统不但可提高计算效率和系统鲁棒性，更可避免私有基因型别数据被上传至不可控的公开数据库中。

(19)中华人民共和国国家知识产权局

(12)发明专利申请

(10)申请公布号CN113611358A

(43)申请公布日2021.11.05

(21)申请号202110915088.X

(22)申请日2021.08.10

(71)申请人苏州鸿晓生物科技有限公司

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