欧洲黑杨与川杨、滇杨杂交及杂种苗的SSR分析的任务书.docxVIP

欧洲黑杨与川杨、滇杨杂交及杂种苗的SSR分析的任务书

任务说明：

为了研究欧洲黑杨、川杨、滇杨杂交及其杂种苗的遗传多样性和遗传关系，建立品种鉴定方法，需要进行分子生物学分析，利用SSR分子标记对不同品种的植株进行遗传分析。本任务书拟定了以下任务流程。

任务流程：

1.样本采集

从不同区域获取欧洲黑杨、川杨、滇杨及其杂交苗的叶片样本，每个品种至少采集50个个体，保证样本的遗传多样性。

2.DNA提取

使用常规的CTAB法提取样本中的总DNA，检测得到的DNA质量和浓度。

3.SSR引物筛选和PCR扩增

选取已经报道过的可重复性高、且在这三种杨树中检测到的SSR引物，并排列成扩增反应体系。反应体系为20μL，包括2μLDNA模板，2μL10×PCRBuffer，0.4μLdNTPs（10mMeach），0.2μL热稳定酶（5U/μL），1μL反向引物（10μM）和1μL正向引物（10μM）。PCR条件：预变性94℃2min，变性94℃45s，退火55℃45s，延伸72℃60s，最终延伸72℃10min。

4.聚丙烯酰胺凝胶电泳分析

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析方法，观察PCR扩增产物大小和数目，评估SSR引物的效果和扩增反应体系的稳定性。

5.数据分析

对得到的PCR产物进行杂交信号的信噪比检测，并分别计算每个位点在样本中出现的频率。利用GenAlEx、POPGENE、STRUCTURE等软件进行聚类和群体遗传学分析，建立品种鉴定模型。

6.结果总结

总结分析结果，得到欧洲黑杨、川杨、滇杨及其杂交苗的遗传多样性和遗传关系，给出品种鉴定方法建议。编制任务报告。