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ntsys软件使用方法集锦
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NTSYS-PC使用说明
1、生成矩阵：在excel按如下规则输入数据，A1=1表示有带记为1，B1=13表示扩增的总条带数，C1=7表示样本数，D1=0表示无带记为0。第二行表示的是样本名称。从第三行开始的A列表示引物名称。见下图：
输入完毕后，将文件以Microsoftexcel5.0/95工作薄的格式存盘。2、生成系统树：
再点击Qualitativedata，出现下面的界面：打开
再点击Qualitativedata，出现下面的界面：
再点SHAN，出现如下界面：点击inputfile，打开生成的excel文件，点击outfile起一个文件名（假设叫A），然后点击compute按钮。继续点击
再点SHAN，出现如下界面：
ntsys软件使用方法集锦
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点击inputfile，打开文件刚才保存的文件111，点击outfile起一个文件名（假设叫222），把Incaseofties改为Find，然后点击compute按钮。计算完成！
点击inputfile，打开文件A，点击outfile起一个文件名（假设叫B），然后点击compute按钮。然后点Graphics
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再点treeplot，出现下面的界面：
点击inputfile，打开文件B，然后点击compute按钮，就会出现聚类图。
3、生成遗传相似度表：
点File中的Editfile,打开文件A，再点compute按钮，就会得到遗传相似度表。
这个软件的功能很强大，但我也只会做聚类图和遗传相似度，如果其他朋友还会使用其它功能，请多交流。
缺失数据可用999代替,写在列的后面,软件就可以识别了
TREEplot
Displaysatreematrix(suchasproducedbytheSAHNmodule)ortheNJOINmodule.
ThealgorithmusedtoconvertatreematrixintoadendrogramdisplayisgiveninRohlf(1975a).AgeneralizationofthisprocedureisusedtoplotatreewithdifferentheightsforeachOTU.
Thetreeisdisplayedonlyapageatatime.ThenumberofOTUsperpagecanbechangedbyeitheropeningtheplotoptionswindoworbypressingthe+or-keys.Thecurrentpagetobedisplayedcanbeselectedeitherfromtheplotoptionswindoworbypressingthezandxkeys.
ParametersProgramparametersandbatchcodes.
?2000byAppliedBiostatistics,Inc.
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