菌株鉴定流程总结.pdfVIP

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  • 2024-03-19 发布于中国
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学习总结

各位领导好,从5月25号开始,在周老师的实验室已经进行了十多天的培训,让我学

到很多。现将我在实验室学习的情况总结汇报。

一、细菌鉴定流程:

1.表观观察鉴定:

培养24h的菌落观察,如:菌落形态(圆形、椭圆形等)、大小(直径多少)、表面

光滑度(光滑和粗糙)和隆起情况(扁平,隆起,凸起等)、边缘整齐、菌落的透明度、菌

落(菌落颜色及是否产生色素等)及培养基的颜色(培养基是否变色)等菌落的描述。

显微观察,观察单个菌的形态(杆状,圆形,椭圆形,螺旋形等),是否有芽孢,

荚膜的情况。

染色观察,革兰氏染色、芽孢染色、荚膜染色。

2.分子鉴定:

细菌DNA的提取(试剂盒法)

⑴将菌种接在适宜的液体培养基中,进行液体发酵,180rpm/min,24h培养。

⑵将摇瓶发酵的菌液加到1.5ml离心管中,10000rpm离心1min,倒掉上清液。

⑶向菌体沉淀中加入200ul缓冲液GA,震荡,至菌体悬浮。如果是革兰氏阳性

菌,则向菌体中加入120ul的Tris盐酸缓冲液,再加入80ul溶菌酶,37℃,30min以上。

⑷向离心管中加入20ul蛋白酶K溶液,混匀。

⑸加入220ul缓冲液GB,震荡15s,70℃放置10min,溶液应变清亮,简短离心

以去除管盖内壁的水珠。

⑹加入220ul无水乙醇,充分震荡混匀15s,可能会出现絮状沉淀,简短离心以

去除管盖内壁的水珠。

⑺将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个离心柱CB3中(吸附柱放入收集管

中),12000rpm离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。

⑻向吸附柱CB3中加入500ul缓冲液GD,12000rpm离心30s,倒掉废液,将吸

附柱CB3放入收集管中。

⑼向吸附柱CB3中加入600ul漂洗液PW,12000rpm离心30s,倒掉废液,将吸

附柱CB3放入收集管中。

⑽重复操作步骤⑼。

⑾将吸附柱CB3放入收集管中,12000rpm离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3

置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。

⑿将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间部位悬空滴加50-200ul

洗脱缓冲液TE(或ddhHO),室温放置2-5min,12000rpm离心2min,将溶液收集到离

2

心管中,-20℃保存。

PCR扩增和电泳检测

细菌扩增引物(16SRrDNA)为:

27F:5-AGAGTTTGATCCTGGTCAGAACGAACGCT-3;

1492R:5-TACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCC-3。

扩增体系:

10xbuffer5μl

dNTP4μl

Mg2+3μl

引物11μl

引物21μl

Taq酶0.4μl

模板2μl

双蒸水33.6μl

总体积50μl

PCR的扩增条件:

Lidtemp:99℃

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