(13)--第二章临床分子生物学检验标志物1.docxVIP

临床分子生物学检验技术

ClinicalLaboratoryofMolecularBiology

第二章临床分子生物字检验标志物

一、生物标志物(biomarker)

二、核酸分子标志物

1.基因组概论

2.原核生物基因组

3.病毒基因组

4.真核生物基因组

三、分子生物标志物的发现与评价

一、生物标忘物(biomarker)

生物标志物(biomarker):可测量并定量的生物学参数，可

作为健康和生理状态的评估指标。

生物标志物分类：

0型：疾病自然病史标志物

1型：药物活性标志物

2型：替代终点

1983年首次提出

生物标志物分类(根据来源):

来自生物样本(如血样、尿样、组织等);

记录值(体温、血压、心电图等);

影像学检查(超声、CT、MRI等)

生物标志物分类(根据用途):

预测性生物标志物；

诊断性生物标志物；

预后性生物标志物；

筛查性生物标志物；

分级性生物标志物；

替代终点

分子生物标志物(molecularbiomarker):是生物标志物的一种类型，是指可以反映集体生理、病理状态的核酸、蛋白质(多肽),

代谢物等生物分子。

分子生物标志物分类：

核酸分子生物标志物(DNA和RNA);

蛋白质生物标志物；

代谢产物生物标志物；

二、核酸分子标忘物

·基因组概论

·.原核生物基因组

·病毒基因组

·真核生物基因组

genome/

cell

chromosomes

…gene…

…gene

Genescontain

instructions

DNAformaking

DNA

proteins

proteins

人体里的天书基因

orincomplexesto

performmanycellular

(一)基因组概论

1、基因组的功能单位——基因

(1)概念：有遗传效应的DNA片段，是控制生物性状的基本遗传单位。

(2)基因的类型

结构基因：基因中编码蛋白质或RNA的DNA序列。

不是所有的基因都能编码蛋白质或RNA

调节基因：是调节蛋白质合成的基因。它对不同染色体上的结构

基因有调节作用。

操纵基因：位于结构基因的一端，是操纵结构基因的基因。

(3)基因的新概念

跳跃基因(转座子)

断裂基因

RNA-guidedDNAinsertionwithCRISPR-associatedtransposases

Science(IF41.037)PubDate:2019-07-05,DOl10.1126/science.aax9181

JonathanStrecker,AlimLadha,ZacharyGardner,JonathanL.Schmid-Burgk,KiraS.Makarova,EugeneV.Koonin,FengZhang

CRISPR-Casnucleasesarepowerfultoolsformanipulatingnucleicacids;however,targetedinsertionofDNA

remainsachallenge,asitrequireshostcellrepairmachinery.HerewecharacterizeaCRISPR-associatedtransposasefromcyanobacteriaSgytonemahofmanni(ShCAST)thatconsistsofTn7-liketransposasesubunitsandthetypeV-KCRISPReffector(Cas12k).ShCASTcatalyzesRNA-guidedDNAtranspositionbyunidirectionallyinsertingsegmentsofDNA60to66basepairsdownstreamoftheprotospacer.ShCASTintegratesDNAintotargetedsitesinthe

Escherichiacoligenomewithfrequenciesofupto80%withoutpositiveselection.Thisworkexpandsour

understandingofthefunctionaldiversityofCRISPR-Cassystemsandestablis