事邑甜茶杂交群体表达谱分析及MhAN1-like基因的功能鉴定的开题报告.docxVIP

事邑甜茶杂交群体表达谱分析及MhAN1-like基因的功能鉴定的开题报告

开题报告

题目：事邑甜茶杂交群体表达谱分析及MhAN1-like基因的功能鉴定

摘要：

事邑甜茶是一种重要的经济植物，其良好的品质和高产量备受关注。近年来，杂交育种逐渐成为茶树育种的重要手段。本研究以事邑甜茶杂交群体为研究对象，采用RNA-seq技术对其表达谱进行分析，以探究杂交组合对基因表达的影响。在此基础上，筛选出一个与花芽形态发育相关的MhAN1-like基因，进一步探究其功能。

研究内容：

（1）采用RNA-seq技术对事邑甜茶杂交群体进行表达谱分析；

（2）分析杂交组合对基因表达的影响，深入挖掘优质杂交组合；

（3）筛选目标基因MhAN1-like，并进行亚细胞定位、表达模式以及表达差异的分析；

（4）对MhAN1-like基因进行功能鉴定，包括基因敲除、表达、互补等实验。

研究意义：

（1）揭示杂交组合对茶树基因表达的影响，为理解茶树杂交遗传机制提供基础；

（2）通过分析MhAN1-like基因的功能，进一步探究事邑甜茶花芽形态发育的机制，为茶树育种和花卉发育学研究提供理论支持。

研究方法：

（1）选取典型杂交组合，分别采集其芽鳞和叶片进行RNA提取；

（2）构建转录组测序库并进行高通量测序；

（3）对测序数据进行质控、拼接、比对、差异表达分析；

（4）筛选目标基因并进行亚细胞定位、表达模式以及表达差异的分析；

（5）对MhAN1-like基因进行功能鉴定，包括基因敲除、表达、互补等实验。

预期结果：

（1）得到事邑甜茶杂交群体的转录组数据，为茶树杂交遗传机制的研究提供数据基础；

（2）发现一个与花芽形态发育相关的MhAN1-like基因，为进一步探究其功能提供了重要线索；

（3）鉴定出MhAN1-like基因在事邑甜茶花芽形态发育中的重要作用，为茶树育种提供理论支持。

研究时间表：

时间节点研究内容

1-2个月RNA提取及质控

2-4个月库构建和测序

4-6个月库拼接及比对分析

6-8个月差异表达基因分析及筛选

8-10个月基因功能鉴定实验

10-12个月数据分析及论文撰写

参考文献：

1.LiuJ,XiaE,ZengS,etal.TranscriptomesequencingandcomparativeanalysisofSaccharumspontaneumandSaccharumofficinarum,twoeconomicallyimportantsugarcanespecies.BMCGenomics,2016,17(1):1-13.

2.ZhangZ,ZhangX,LinZ,etal.Transcriptomeanalysisrevealsarichgenesetrelatedtoinnateimmunityintheeasternoyster(Crassostreavirginica).MarineBiotechnology,2011,13(2):195-207.

3.LiuJ,SunY,LiuM,etal.Comparativetranscriptomeanalysisofgrapevineinresponsetocopperstress.ScientiaHorticulturae,2020,266:109245.