蛋白质分子设计.pptVIP

**2003年BrianKuhlman等人利用ROSETTA来设计成功一种称为Top7的α/β新蛋白，氨基酸序列和蛋白拓扑结构都是新颖的**第一步，利用代表目标蛋白折叠的几何参数来定义一个理想的蛋白质骨架：骨架中心是一个8条平行链的β-片状（sheet），四周由8个α螺旋环绕，β-片状在筒的两边与短结构的转角相连。第二步，运用一个基于死端排除法（DEE,DeadEndElimination）原则的自动序列选择运算，找出适合该目标结构的最佳氨基酸序列，经合成基因、蛋白表达、蛋白性质检测以及测定NMR结构，证实设计获得理想的目标蛋白。**四螺旋束和β筒结构都是自然界中广泛存在的结构类型，例如细胞色素b562、蚯蚓血红蛋白、烟草镶嵌病毒外壳蛋白等许多蛋白质都含有相连的四螺旋束。这些蛋白质的同源性很小，但巧的是都具有相似的三维结构，这显示了这类结构的稳定性，因此四螺旋束结构类型成为从头设计蛋白质的首选目标。四螺旋束结构可以作为一个独立的折叠单位，易于独立研究，最早由W．F．DeGrado等应用“设计循环”的策略完成了一个四聚体螺旋束的设计。**由于四螺旋束中4条链的相互制约，每段螺旋的末段都向外张开，创造了一个潜在的结合位点。这项工作被誉为蛋白质分子设计的第一个里程碑。*************IPTG:异丙基-β-D-硫