分子生物学基础 (1).doc

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在第七章我们以乳糖操纵子为例讲解了原核生物基因表达调控的方式。当然，原核生物中并不是每一个基因的表达都是受到操纵子调控的，也有很多是单基因表达调控。在第八章我们将介绍真核生物基因表达调控方式。

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我将按照以下几个小节给同学们讲解，首先是介绍真核基因组以及基因的基本结构，接着是介绍真核染色体的基本结构：核小体；然后是真核基因的转录过程及调控元件；我还将简单总结真核和原核基因表达调控的相似性以及之间的差异。

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先看看真核基因组以及基因的基本结构

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在了解真核基因组以及基因结构之前，我们需要先看一下真核细胞与原核细胞的结构差异：真核细胞一般比原核细胞大；原核细胞没有细胞核，真核细胞有明显的双层膜包裹的细胞核；原核细胞一般只有一条裸露的基因组DNA，而真核细胞的基因组DNA与组蛋白及多种其它蛋白质广泛互作后得到高度折叠和压缩，最后以染色体形态存在于细胞核中，且真核细胞往往有多条染色体；原核细胞没有明显的亚细胞器，而真核生物含有内质网、高尔基体、线粒体、溶酶体、过氧化物酶体、各种转运小泡等多种结构和功能特化的亚细胞器。从细胞结构的复杂性比较可知，真核细胞的基因表达调控一定更加复杂、更加精细。

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确实，真核生物的基因组DNA量一般要显著大于原核生物，基因组所含的总基因数目远多于原核生物。这张图比较了人、小鼠、拟南芥、线虫、酵母、大肠杆菌、艾滋病毒HIV的基因组大小以及基因总数。人的基因组含约3x10^9个碱基对，大肠杆菌约4.6x10^6，约有1000倍的差异；令人惊讶的是，尽管人和大肠杆菌基因组DNA量相差1000倍，人基因组只含30,000多个基因，而大肠杆菌的约3,200个基因，只有10倍的差异。

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在基因组DNA构成方面，人基因组DNA的量是大肠杆菌的1000倍，而基因总数却只有10倍，这说明人的基因组DNA中有很多是非编码DNA。确实是，目前已经知道，原核生物往往只有一条基因组DNA，基因之间很少有多余的DNA，因此基因密度高。而在高等真核生物中，非编码DNA的量往往是基因编码DNA的7倍以上，真核生物非编码DNA由很多类型组成，包括各类重复DNA、长非编码DNA、内含子等等。

在基因结构方面，人的总基因数只有大肠杆菌的10倍，鉴于人生命体要远远比大肠杆菌复杂，这说明真核生物的基因结构一定比原核生物复杂。简单总结来说，1、真核基因是单顺反子，也就是说一个启动子控制一个基因的表达；2、绝大部分真核基因具有外显子和内含子，它们一同被转录，之后通过剪接将内含子移去，同时将外显子拼接并经一定的修饰后形成成熟的信使RNA，也即mRNA；3、很多基因有多个基因拷贝数或有多个同源基因。

在基因表达调控方面，除了启动子区域之外，真核基因表达还受到启动子上游调控元件，也即顺式调控元件的调控，很多真核基因表达还会受到基因区域之外的远程调控元件，如增强子。此外，真核基因表达也受到DNA修饰和组蛋白修饰调控等等。

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我们前面提到，真核细胞的基因组DNA与组蛋白及多种其它蛋白质广泛互作后得到高度折叠和压缩后，最终以染色体形态存在于细胞核中。在讲解真核基因表达调控之前，我们首先需要了解染色体的基本单位：核小体。

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前面提到人的基因组DNA含约3x109bp，同学们可能没有想到，如果把人单倍体基因组DNA拉直，其长度可以达到1米长，考虑到体细胞是双倍体，这样，人单个体细胞基因组DNA拉直后可以达到两米，超过绝大多数人的高度。但是2m长的DNA是如何折叠压缩到一个肉眼看不到、只有10μm的细胞核里的呢？折叠压缩到细胞核不是最终目的，还需要满足以下几个基本要求：折叠压缩后要保证DNA链之间不能打结，高度折叠压缩的DNA要能及时被打开以满足基因表达的需求，高度折叠压缩的DNA要能被全部被打开并准确地复制传给下一代。

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因此，细胞生物学一个关键的科学问题就是：染色体是如何形成的？大量的实验已经证明，染色体最基本的组建单位是核小体，染色体就是一个个核小体串联在一起并进一步折叠后形成的特殊的DNA-蛋白质复合体。

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核小体的核心是由四种组蛋白H2A、H2B、H3、H4各两份组成的八聚体，DNA链环绕这个八聚体约两圈，也即约147bp。而另一个组蛋白H1与核小体之间的DNA链结合，由此将一个个核小体串联在一起形成染色质一级结构。组蛋白是一类特殊的碱性蛋白，富含赖氨酸和精氨酸，故带正电荷。由于DNA是酸性物质，带负电荷，因此DNA与组蛋白有很强的结合力，并形成相对稳定的结构。特别需指出的是，组蛋白不仅是染色体的结构蛋白，至今的研究证明组蛋白的修饰及其动态变化在调控基因表达中起着重要作用。

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有了核小体串联的染色质一级结构之后，多个核小体以螺旋状聚集压缩形成染色体纤丝，染色体纤丝可被进一步压缩形成染色质三级