(41)--1.4.1 蛋白质结构 蛋白质分离.ppt

****三级结构可含有功能各异的结构域大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域，折叠得较为紧密，各行使其功能，称为结构域(domain)。第一专题蛋白质化学*羊毛和真丝弹性比较*？？？**蛋白质结构一蛋白质分类二蛋白质性质三第四节蛋白质蛋白质分离四**一、蛋白质结构四1一级结构2二级结构3三级结构4四级结构**高级结构或空间构象(conformation)一级结构(primarystructure)二级结构(secondarystructure)三级结构(tertiarystructure)四级结构(quaternarystructure)**胰岛素的三维结构**1.一级结构蛋白质一级结构(primarystructure)是指蛋白质分子中，从N端到C端的氨基酸排列顺序。形成一级结构的化学键：肽键（主要化学键）二硫键**一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础，但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。**化学或反向遗传学方法分析或演绎多肽链的氨基酸序列分析已纯化蛋白质的氨基酸残基组成（离子交换层析）测定多肽链的氨基末端与羧基末端为何种氨基酸残基把肽链水解成片段，分别进行分析测定各肽段的氨基酸排列顺序，一般采用Edman降解法一般需用数种水解法，并分析出各肽段中的氨基酸顺序，然后经过组合排列对比，最终得出完整肽链中氨基酸顺序的结果。**例：镰刀形红细胞贫血重要蛋白质氨基酸序列的改变可引起疾病镰刀形红细胞贫血症是一种常染色体隐性基因遗传病。主要症状是贫血。病人衰弱、头晕、气短、心脏有杂音和脉搏增高。患病者的血液红细胞表现为镰刀状，其携带氧的功能只有正常红细胞的一半。****2.二级结构蛋白质二级结构(secondarystructure)是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象。**肽键是一个刚性的平面参与肽键的6个原子C?1、C、O、N、H、C?2位于同一平面，C?1和C?2在平面上所处的位置为反式(trans)构型，此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元(peptideunit)。**?-螺旋(?-helix)?-折叠(?-pleatedsheet)?-转角(?-turn)无规卷曲(randomcoil)蛋白质二级结构的主要形式：维系二级结构的主要化学键：氢键**?-螺旋是常见的蛋白质二级结构**α-螺旋连续排列的酰胺平面旋转形成面螺旋右手螺旋酰胺平面与螺旋的长轴平行一个AA0.15nm,每3.6个为一圈(0.54nm)螺旋借助相邻两圈之-NH---CO-稳定AA的侧链伸向螺旋外侧AA的大小和电荷可以影响螺旋的形成**?-折叠使多肽链形成片层结构**平行式：所有参与β-折叠的肽链的N端在同一方向。反平行式：肽链的极性一顺一倒，N端间隔相同**β-折叠较为伸展,酰胺平面以锯齿状排列两个片段可以是平行或反平行AA间距平行0.65nm反平行0.67nm只有片段间氢键,无片段内氢键AA的侧链伸向锯齿状结构的外侧小侧链的AA有利于β-折叠的生成**?-转角和无规卷曲在蛋白质分子中普遍存在?-转角**无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。**应用物理学、生物信息学原理可进行蛋白质空间结构测定或预测通常采用圆二色光谱(circulardichroism，CD)测定溶液状态下的蛋白质二级结构含量。?-螺旋的CD峰有222nm处的负峰、208nm处的负峰和198nm处的正峰三个成分；?-折叠在216nm处有一负峰，在185nm-200nm处有一正峰。而?-转角CD谱不很固定。二级结构测定**SP175参考蛋白库CD光谱**氨基酸残基的侧链可影响二级结构的形成蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成?-螺旋或β-折叠，它就会出现相应的二级结构。这是氨基酸残基的侧链的相互作用可稳定或去稳定相应的二级结构的原因。**一段肽链有多个酸性氨基酸残基相邻，则在pH7.0时这些残基的游离羧基都带负电荷，彼此相斥，妨碍α-螺旋的形成。同样，多个碱性氨基酸残基在一肽段内，由于正电荷相斥，也妨碍α-螺旋的形成。**天冬酰胺、