赣南师范大学2024年研究生招生考试大纲 《生物信息学》考试大纲及参考书.docVIP

PAGE

PAGE4

《生物信息学》考试大纲及参考书

科目名称：生物信息学

适用专业：电子信息（原农业工程）生物信息学方向

参考书目：陈铭主编.《生物信息学》（第三版）.科学出版社，2022

考试基本要求：

掌握生物信息学的定义、基本概念和发展；掌握生物信息学研究的基本内容、基本原理和生物学基础；了解计算机在生物研究中的应用；了解生物信息学发展史、开发与产业化；

掌握生物信息学常用数据库和使用方法；掌握序列比对方法和主要比对软件使用方法；掌握DNA序列和蛋白质序列特征分析和常用序列分析软件包使用方法；

掌握分子进化理论和常用分析方法；了解统计学习与推理基本概念与方法；了解合成生物学基本概念与研究策略；

掌握基因功能注释方法和常用软件使用方法；掌握基因表达数据分析方法和常用分析软件使用方法；掌握生物信息学编程常用语言。

考试方法：闭卷书面解答

试题类型：名词解释、简答题、综合论述等。

第一章生物信息学的概念及其发展历史

生物信息学的发展历史

生物信息学的研究领域

生物信息学的主要应用

生物信息学面临的挑战

第二章生物学数据库及其检索

生物学数据库简介

生物学数据库的内容与结构

生物学数据库的检索

第三章序列比对原理

序列比对相关概念

序列比对打分方法

序列比对算法

序列比对工具

多序列比对

第四章蛋白质结构预测与分析

蛋白质结构组织层次

蛋白质结构的测定与理论预测

蛋白质对接

蛋白质折叠与疾病

第五章真核生物基因组的注释

蛋白质编码基因的注释

RNA基因的注释

重复序列的注释

假基因的注释

第六章蛋白质组学

蛋白质组学概述

蛋白质的大规模分离鉴定技术

蛋白质的翻译后修饰

蛋白质分选

蛋白质相互作用

第七章系统生物学

系统生物学基本概念

系统生物学基本技术与方法

先进的成像技术

基因表达调控网络

代谢网络

信号转导途径

蛋白质一蛋白质相互作用网络

虚拟细胞

第八章合成生物学

合成生物学概述

合成生物学基础研究经典实例

合成生物学应用研究经典实例

第九章分子进化与系统发育

分子进化与系统发育

分子系统发育树的构建方法

系统发育树构建及应用

第十章统计学习与推理

统计学习与推理基础

统计模型与参数推断

聚类分析、主成分分析与Fisher判别

贝叶斯推理

隐马尔可夫模型

动态神经网络

第十一章生物信息学编程基础

Linux操作系统

生物信息学中的编程语言

第十二章第二代测序技术及其应用

测序技术概述

第二代测序原理

第二代测序技术的应用

生物信息学在第二代测序中的应用