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umna®DirectionalmRNA-SeqLibraryPrep.
Pre-ReleaseProtocol
Introduction
Thisprotocolexplainshowtopreparedirectional,orstrandspecific,librariesfrommRNA.Tech
Supportmaybeunabletoprovidedetailedsupportforthispre-releaseprotocol.Thefinal
releasedproductmaydifferfrompre-releaseprotocols.
Librariespreparedbythismethodarecompatibleonlywithsinglereadflowcells.TheSmall
RNAsequencingprimer(part#1001375)andSingleReadSequencingProtocolshouldbeused
forthesequencingreactions.
Workflow
Poly-AselectionEndrepairofRNALigationofRT-PCRAmplify
FragmentationofmRNAwithphosphatasePNK3and5Adaptors
Pre-ReleaseProtocolRequiredComponents
IlluminaSuppliedComponents
ThisprotocolrequirestheSmallRNASamplePrepKitwiththev1.5sRNA3Adaptor:
(8samples)FC-102-1009or(40samples)FC-102-1010
FormRNAselectionandfragmentation,Illuminarecommendsusingcomponentsfrom
themRNA-Seqlibraryprepkit(RS-100-0801).Alternativepoly-Aselectionmethods
maybeusedbuthavenotbeentestedorverified.TheoutputmRNAmustbeofhigh
qualityandfreeofinhibitors.
UserSuppliedSupplementalComponents
SeeSmallRNASamplePrepProtocolforstandardusersuppliedcomponentsplusthe
additionalcomponentslistedbelow:
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