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- 2024-05-15 发布于北京
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Variance-stabilizingtransformationforDESeq
Forparametrizeddispersionfit
Thisfiledescribesthevariancestabilizingtransformation(VST)usedbyDESeqwhenparametricdispersionestimationis
used.
ThisisaMathematicanotebook.Thefilevst.pdfisproducedfromvst.nb.
WhenusingestimateDispersionswithfitType=parametric,weparametrizetherelationbetweenmeananddispersion
withtwoconstantsaandaasfollows:
01
aa
01
a1
a
0
Inthepackage,
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