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儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识解读（全文）

病毒、细菌、非典型病原体、真菌等，近年来，新型冠状病毒、禽流

感病毒等新发再发呼吸道感染病原体也对儿童生命健康造成了严重威

胁。

快速准确的病原学诊断对于该类疾病的临床诊疗及防控具有重要意义。

核酸检测方法因具有较高的灵敏度和特异性，得以快速地在临床推广

应用，成为呼吸道感染病原体诊断的主要方法。

为规范儿童呼吸道感染病原体核酸检测的临床应用、指导儿童呼吸道

感染病原体的核酸检测并整体提升儿童呼吸道感染病原体的诊断能力，

19位相关领域专家共同撰写《儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共

识》（以下简称《共识》），并发表于中华实用儿科临床杂志。

该《共识》首先概述了常见的病原体核酸检测方法，随后针对不同检

测方法推荐了适用的人群，并介绍了不同情况、不同病原体应选择的

合适标本类型。检测完成后，《指南》详细描述了检测结果解读及注

意事项，并介绍了该结果对于指导临床用药的意义。

.《指南》内容概述

以是否依赖于基因组序列特征分为基因组序列依赖性和非依赖性两类

方法，前者是根据已知的病原体基因组序列设计特异性引物，靶向性

地进行病原体核酸扩增和检测的方法，如聚合酶链反应(polymerase

chainreaction，PCR)；后者以mNGS为代表，是对样本中的病原体

序列进行高通量测序，将获得的序列与数据库中序列进行比对分析而

确定病原体的方法。

病原体核酸检测方法按照技术原理又可分为核酸扩增、核酸杂交、基

因测序、CRISPR(clusteredregularlyinterspacedshort

palindromicrepeats)技术等。常见的核酸检测方法概述见图二。

图二.常见的核酸检测技术

《共识》根据各种核酸检测方法进行优缺点分析，对呼吸道病原体核

酸检测适用的人群推荐如下图三：

图三.核酸检测试验推荐人群

三、呼吸道病原体核酸检测的

标本类型及选择

《共识》对呼吸道病原体核酸检测的适宜标本类型进行了介绍，以及

分别对不同病原体检测的标本类型选择做出建议，如图四。对于不同

标本的采集和转运方式，《共识》中引用了美国传染病学会和美国微

生物学会2018年更新的“用于传染病诊断的微生物实验室使用指南”

的表格，见表一。

图四.核酸检测的标本选择

表1呼吸道感染病原核酸检测

推荐标本及转运注意事项

4.1常规核酸检测

同一份标本可能检出多种病原体，需要明确哪一种是主要病原体，同

时也需要警惕样本污染的可能，应结合临床表现、病原体流行特征进

行区分。上、下呼吸道标本的病原体核酸阳性结果在病毒、细菌、非

典型病原体以及真菌感染中的诊断价值有一定区别，详见下图五。

图五.常规核酸检测结果解读

另外，检测结果为阴性时，一方面可以考虑排除某种病原体感染；若

结合临床高度怀疑某病原体及感染时，要考虑标本或检测问题，临床

及时与实验室沟通。

4.2mNGS

目前，mNGS技术（病原宏基因组测序）的标准操作、数据分析、结

果判读等尚无标准化流程。但随着其在临床上的不断推广，国内临床

对mNGS技术中存在的某些共性

问题，尤其是结果报告和解读提出建议。

图六.mNGS检测结果解读

以病原学检测结果为参考，应结合具体临床表现及病原体的流行病学

资料，进行临床综合评估，谨慎地选择抗病毒药物。进行治疗时，也

要充分考虑患儿对治疗的实际反应。

.病原体核酸检测结果指导临床用药

核酸检测方法具有较高的灵敏度和特异度，是儿童呼吸道病原体诊断

的主要方法。多重核酸检测的合理应用有利于儿童呼吸道感染的病原

学辅助诊断；mNGS技术是未知病原体检测的强力有效手段。