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20XXR语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用目录
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用多维数据进行层次聚类的缺点主要有?计算时间复杂度大?。每次都要计算多个cluster内所有数据点的两两距离?得到的聚类结果是局域最优，不一定是全局最优?。层次聚类使用的是贪心算法
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用因此本实验选择先将数据进行主成分分析降维，再进行层次聚类主成分分析：主成分分析(PCA)，主成分分析是一种降维算法，它能将多个指标转换为少数几个主成分，这些主成分是原始变量的线性组合，且彼此之间互不相关，其能反映出原始数据的大部分信息。一般来说，当研究的问题涉及到多变量且变量之间存在很强的相关性时，我们可考虑使用主成分分析的方法来对数据进行简化。本实验主要是利用了pca的数据降维能力数据：本文采用了30位学生的5门课程成绩来作为实验数据。如图
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用主成分分析法的前提是需要变量具有相关性，因此，我们需要先查看下各个变量的相关程度
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用运行结果为
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用纵观整个相关系数矩阵，各个变量之间均存在一定的相关性,可进行后续的主成分分析3.确定主成分个数以及主成分一般地，在计算相关系数矩阵后，通过求出其特征值与特征向量，进而计算方差贡献率与累计方差贡献率，这两步操作均可以由R中的princomp函数一步实现确定主成分准则：特征值大于1或累计方差贡献率大于80%(这个值具体需要根据主成分的个数与保留信息综合考虑确定)代码如下
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用结果如下
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用从累计贡献率知，前两个成分的累计贡献率就以及接近90%，故选取前两个成分作为主成分
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用主成分前六行预览如下层次聚类分析
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用将所选的前两列主成分转入空数据框中为后续运算做准备，并计算两列主成分的欧氏距离，使用这些距离数据进行层次聚类
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用聚类效果如图：我们发现分为两类时效果最好
R语言中主成分分析在层次聚类分析中的应用用红框标起来更为清晰
-14THANKS感谢恩师
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