3.8 跳跃基因-真核生物的反转录转座子.pdfVIP

3.8 跳跃基因-真核生物的反转录转座子.pdf

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跳跃基因—

真核生物的反转录转座子

曲良焕

华中农业大学

I型;剪贴式转座因子(Cut-paste)

II型;反转录转座子(Retro-transposon

类似反转录病毒)

II型;反转录转座子(Retro-transposon

类似反转录病毒)

CopiainDrosophila

Ty1inyeast

Alufamily

在真核生物中普遍存在

•高等植物中的反转录转座子

植物中随物种和反转录转座子类型不同

反转录转座子的分子大小

从1000~9300bp

LTRs大小

从120~2400bp

分布

Ty1-copia;苔藓门,蕨类门,裸子植物门,被子植物门

Ty3-gypsy;玉米和一种百合植物

LINE;玉米、甜菜、拟南芥和一种百合植物

约100多种,几乎覆盖所有植物类群

●反转录转座子的转座方式及特点

DNA→RNA→DNA

mRNA/cDNA

DScDNA

高度的遗传

稳定性

高拷贝性

玉米;基因间几乎由具LTRs反转录转座子填充

多数DNA结构完整

部分呈相嵌(chimera)方式

LTR1

LTR2

物种反转座子种类拷贝数

玉米(Zeamays)LINE50-100

烟草(Nicotianatabacum)Ty1-copia>100

水稻(Oryzasativa)Ty1-copia1000

拟南芥(Arabidopsisthalina)Ty1-copia0.1%ofC

玉米(Zeamays)Ty1-copiaTy3-gypsy50%ofC

高等植物基因组大小(C)的差异

主要由反转座子拷贝数所造成

PNASJuly17.2001.vol.98.no.15p8163-8164

形成四倍体

反转座子爆炸

反转座子约占玉米

基因组80%

genegenegene

TensofMbpofsatelliterepeatsequenceinterspersedwithRTE(PNAS,1998,p395-406)

RTEpreferto

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