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跳跃基因—
真核生物的反转录转座子
曲良焕
华中农业大学
I型;剪贴式转座因子(Cut-paste)
II型;反转录转座子(Retro-transposon
类似反转录病毒)
II型;反转录转座子(Retro-transposon
类似反转录病毒)
CopiainDrosophila
Ty1inyeast
Alufamily
在真核生物中普遍存在
•高等植物中的反转录转座子
植物中随物种和反转录转座子类型不同
反转录转座子的分子大小
从1000~9300bp
LTRs大小
从120~2400bp
分布
Ty1-copia;苔藓门,蕨类门,裸子植物门,被子植物门
Ty3-gypsy;玉米和一种百合植物
LINE;玉米、甜菜、拟南芥和一种百合植物
约100多种,几乎覆盖所有植物类群
●反转录转座子的转座方式及特点
DNA→RNA→DNA
mRNA/cDNA
DScDNA
高度的遗传
稳定性
高拷贝性
玉米;基因间几乎由具LTRs反转录转座子填充
多数DNA结构完整
部分呈相嵌(chimera)方式
LTR1
LTR2
物种反转座子种类拷贝数
玉米(Zeamays)LINE50-100
烟草(Nicotianatabacum)Ty1-copia>100
水稻(Oryzasativa)Ty1-copia1000
拟南芥(Arabidopsisthalina)Ty1-copia0.1%ofC
玉米(Zeamays)Ty1-copiaTy3-gypsy50%ofC
高等植物基因组大小(C)的差异
主要由反转座子拷贝数所造成
PNASJuly17.2001.vol.98.no.15p8163-8164
形成四倍体
反转座子爆炸
反转座子约占玉米
基因组80%
genegenegene
TensofMbpofsatelliterepeatsequenceinterspersedwithRTE(PNAS,1998,p395-406)
RTEpreferto
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