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伪狂犬病毒、猪细小病毒和猪圆环病毒2型三重荧光PCR检测方法
1范围
本文件规定了伪狂犬病毒、猪细小病毒和猪圆环病毒2型三重荧光RT-PCR检测方法操作规程。
本文件适用于伪狂犬病毒、猪细小病毒和猪圆环病毒2型的鉴别诊断。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB19489实验室生物安全通用要求
NY/T541动物疫病实验室检验采样方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
三重荧光PCRTriplexrealtimePCR
三重荧光聚合酶链式反应。
3.2
Ct值Cyclethreshold
每个反应孔内的荧光信号达到设定阈值时所经历的循环次数。
4缩略语
下列缩略语适用于本文件。
PRV:伪狂犬病毒(PorcinePseudorabiesVirus)
PPV:猪细小病毒(PorcineParvovirus)
PCV-2:猪圆环病毒2型(PorcineCircovirustype2)
FAM:6-羧基荧光素(6-Carboxyfluorescein)
Cy5:荧光发光基团
Hex:六氯-6-甲基荧光素(6-Hexachlorofluorescein)
BHQ:荧光淬灭基团
1
5仪器和设备
多通道荧光PCR仪、生物安全柜、冰箱(2℃~6℃和-20℃)、台式冷冻离心机、组织匀浆机、漩涡
器、移液器及吸头(至少包括10μL、200μL和1000μL三个量程)。
6试剂和材料
6.1病毒总核酸提取试剂TIANampVirusDNA/RNAKit或者其他等效核酸提取试剂。
6.2IQPowermixPCRkit或者其他等效多重荧光PCR试剂。
6.3无水乙醇(分析纯)和75%乙醇(用新开启的分析纯无水乙醇和DEPC处理水配制)及实验用水按
照GB/T6682《分析实验室用水规格和试验方法》规定使用,-20℃预冷。
6.4阳性对照
含伪狂犬病毒(PRV)gE基因的体外重组质粒、含猪细小病毒(PPV)NS1基因的体外重组质粒、含
猪圆环病毒2型(PCV-2)ORF2基因的体外重组质粒,序列片段序列见附录A。
6.5阴性对照
伪狂犬病毒病毒阴性样品、猪细小病毒阴性样品和猪圆环病毒2型阴性样品。
6.6引物和探针序列
引物和探针序列见附录B。
7病料采集和处理
病料采集和处理,请遵照NY/T541《动物疫病实验室检验采样方法》有关规定进行操作。
8病毒总核酸的提取
见附录C。
9荧光PCR反应
9.1多重荧光PCR反应体系
多重荧光PCR反应体系配制见表1。
表1一步法多重荧光PCR反应体系(总体积20uL)
混合液组份体积(uL)终浓度(nM)
2×IQPowermixPCR缓冲液101×
引物混合物0.8400
2
PCV-2探针(FAM标记)0.4200
PRV探针(Cy5标记)0.4200
PPV探针(Hex标记)0.4200
病毒总核酸
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