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乌桕花芽转录组测序分析及花发育调控机制研究的开题报告

一、项目背景与概述

乌桕（CeltissinensisPers.）是一种常见的落叶乔木，广泛分布于中国南方地区。乌桕作为一种食用和药用植物，具有很高的经济价值。乌桕花期集中、花期较长，是诸多昆虫和钨鸟的重要食物来源，也是各种观赏花木中重要的组成部分。

花的形态和性状是植物繁殖过程中的重要表现形式。目前，对于乌桕花发育中的分子机制仍知之甚少。因此，本项目计划使用RNA-seq技术对乌桕花芽进行转录组测序，结合生物信息学方法在不同发育阶段分析转录组差异表达基因，并进一步研究调控花发育的关键基因及其通路。

二、研究内容与技术路线

1.实验设计

本项目选取乌桕花发育中5个关键时期的花芽进行转录组测序（未分化的花芽、分化的花芽、花蕾、开放的花朵、凋谢的花朵），并使用多通路分析方法研究关键质量TQ（厚度、细胞数量和细胞质量）和QC（质量控制）的关键信号途径。

2.转录组测序及数据分析

利用IlluminaHiSeq4000平台对5个不同发育阶段的乌桕花芽进行转录组测序，获得高质量的RNA-seq数据。数据清洗、质量控制和数据预处理后进行基因表达差异分析和GO、KEGG功能富集分析以及WGCNA等多项生物信息学数据分析方法，鉴定差异表达基因及其富集通路。

3.基因验证与通路调控机制分析

选取关键差异表达基因进行RT-PCR验证，并对差异表达基因进行功能注释和互作网络分析，挖掘不同阶段花发育中的关键转录因子及其调控通路，最终寻找关键调控基因和通路及其对应的调控机制。

三、预期成果

1.完成乌桕花芽转录组测序数据的采集、分析及基因功能注释和富集分析，并鉴定不同发育阶段下的关键差异表达基因。

2.建立花发育中的关键转录因子及其调控通路等生物信息图谱；

3.研究不同发育时期的乌桕花发育调控机制及相关基因及通路；

4.奠定乌桕花发育调控分子机制的研究基础，为乌桕分类和进化、育种改良以及利用乌桕资源提供理论基础。

四、项目意义

本项目将通过对乌桕花芽转录组测序分析及花发育调控机制研究，解决对乌桕花发育的分子机制仍然知之甚少的问题，有助于更深入地了解植物花器官发育中的分子机制，为植物发育生物学提供新的研究思路和实验范式。此外，本研究也有助于深入挖掘乌桕植物资源所具有的潜在价值，为其开发利用提供新的科学依据。