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农业生物技术学报
JournalofAgriculturalBiotechnology
2024,32(5):1008~1019
DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2024.05.003
番茄β-BAM基因家族全基因组鉴定及其盐胁迫和外源植物生长调节
剂下的表达分析
1,21,21,2111*
李贤国陈兆龙王泽鹏戴麒余庆辉李宁
1新疆农业科学院园艺作物研究所/新疆特色果蔬基因组研究与遗传改良重点实验室,乌鲁木齐830091;2新疆农业大学园艺学院,乌鲁木
齐830052
*通讯作者,lining@
摘要β-淀粉酶(β-amylase,BAM)广泛参与植物体内各种生物学过程的调控,并响应激素与非生物胁
迫等多种外界刺激。本研究通过生物信息分析,在番茄(Solanumlycopersicum)中鉴定出8个SlBAM成员,
并进行了理化性质、基因结构、系统进化、共线性等分析;使用qPCR对SlBAM基因在盐胁迫和果实发育
下的表达模式进行分析。结果表明,SlBAM均具有典型的Glyco_hydro_14结构域,多数SlBAM呈酸性,
且都为亲水蛋白。系统发育分析显示,SlBAM可分为6个类群,相同类群具有相似的基因结构及基序分
布。顺式作用元件组成表明,大部分SlBAM的表达可能与植物激素、非生物胁迫和光反应等相关。共线
性分析结果显示,番茄与拟南芥BAM基因家族有一定的同源性,与马铃薯(Solanumtuberosum)亲缘关系
更近。qRT-PCR分析发现,SlBAM基因主要在叶中表达,在根和茎中表达量较低。在盐胁迫下,SlBAM2、
SlBAM4和SlBAM6表达上调(P<0.05),SlBAM1和SlBAM3表达下调(P<0.05)。当外源激素2,4-油菜素内
酯(2,4-epibrassinolide,EBS)浓度为0.1mol/L时,绿熟期番茄的所有SlBAM基因都显著上调(P<0.05)。
在α-萘乙酸(1-naphthaleneaceticacid,NAA)影响下,除SlBAM6外的所有SlBAM基因都表达上调,只有
SlBAM6表达下调。本研究为进一步揭示番茄BAM基因家族在响应非生物胁迫及其在果实发育中的功
能提供了参考依据。
关键词番茄;β-淀粉酶(BAM);生物信息学;盐胁迫;外源激素
中图分类号S641.2文献标识码A
Genome-wideIdentificationofTomato(Solanumlycopersicum)β-BAM
GeneFamilyandItsExpressionAnalysisUnderSaltStressand
ExogenousPlantGrowthRegulators
LIXian-Guo1,2CHENZhao-Long1,2WANGZe-Peng1,2DAIQi1YUQing-Hui1LINing1*
1InstituteofHorticulturalCrops/KeyLaboratoryofGenomeResearchandGeneticImprovementofXinjiangCharacteristicFruitsand
Vegetables,XinjiangAcademyofAgriculturalSciences,Urumqi830091,China;2CollegeofHorticulture,XinjiangAgriculturalUniversity,
Urumqi830052,China
*Correspondingauthor,lining@
Abstract
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